37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3041 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3041  hypothetical protein  100 
 
 		 822 aa  1661    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.229998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0226  hypothetical protein  48.14 
 
 		 897 aa  634  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3771  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 810 aa  348  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3208  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 823 aa  335  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00709825  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0469  hypothetical protein  33.48 
 
 		 908 aa  332  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5846  hypothetical protein  30.29 
 
 		 817 aa  317  4e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5019  hypothetical protein  28.07 
 
 		 815 aa  283  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351905  normal  0.0490542 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2372  hypothetical protein  29.19 
 
 		 918 aa  262  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0691325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4404  hypothetical protein  28.39 
 
 		 798 aa  260  9e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1225  hypothetical protein  27.02 
 
 		 801 aa  249  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623353  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4550  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 1192 aa  237  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 1182 aa  234  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0719  hypothetical protein  28.2 
 
 		 787 aa  158  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  24.39 
 
 		 1411 aa  123  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2457  hypothetical protein  23.74 
 
 		 756 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0554  hypothetical protein  30.57 
 
 		 823 aa  60.8  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.195396  normal  0.0453352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1434  hypothetical protein  32.58 
 
 		 575 aa  57.8  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  35.58 
 
 		 1014 aa  52.4  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  36.17 
 
 		 1139 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1105 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08741  hypothetical protein  23.34 
 
 		 558 aa  47.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1155 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 1080 aa  47  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 1027 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  34 
 
 		 1039 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6126  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 986 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  37.5 
 
 		 1064 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  31.91 
 
 		 1018 aa  45.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 1063 aa  45.8  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  35.82 
 
 		 1018 aa  45.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 1150 aa  45.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  36.17 
 
 		 1013 aa  45.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1038 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 1128 aa  44.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  36 
 
 		 1211 aa  44.7  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  32.46 
 
 		 1102 aa  44.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1064 aa  44.3  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>