17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2457 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2457  hypothetical protein  100 
 
 		 756 aa  1575    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3771  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 810 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3208  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 823 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00709825  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5019  hypothetical protein  28.26 
 
 		 815 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351905  normal  0.0490542 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5846  hypothetical protein  28.12 
 
 		 817 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4404  hypothetical protein  25.49 
 
 		 798 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2372  hypothetical protein  29.43 
 
 		 918 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0691325 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1225  hypothetical protein  23.45 
 
 		 801 aa  111  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623353  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  22.85 
 
 		 1411 aa  104  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0554  hypothetical protein  23.43 
 
 		 823 aa  104  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.195396  normal  0.0453352 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3041  hypothetical protein  23.74 
 
 		 822 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.229998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4550  TonB-dependent receptor plug  23.49 
 
 		 1192 aa  92  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  24.69 
 
 		 1182 aa  88.2  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0469  hypothetical protein  27.39 
 
 		 908 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0226  hypothetical protein  24.38 
 
 		 897 aa  75.5  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0719  hypothetical protein  29.81 
 
 		 787 aa  68.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08741  hypothetical protein  29.17 
 
 		 558 aa  45.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>