More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3208 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3208  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 823 aa  1677    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00709825  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3771  TonB-dependent receptor plug  43.21 
 
 		 810 aa  659    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3041  hypothetical protein  29.49 
 
 		 822 aa  345  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.229998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5019  hypothetical protein  29.51 
 
 		 815 aa  333  8e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351905  normal  0.0490542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1225  hypothetical protein  31.6 
 
 		 801 aa  331  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623353  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0226  hypothetical protein  34 
 
 		 897 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4550  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1192 aa  319  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4404  hypothetical protein  28.89 
 
 		 798 aa  317  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5846  hypothetical protein  30.4 
 
 		 817 aa  312  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1182 aa  310  8e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0469  hypothetical protein  29.05 
 
 		 908 aa  258  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2372  hypothetical protein  28.57 
 
 		 918 aa  234  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0691325 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  38.46 
 
 		 1411 aa  175  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2457  hypothetical protein  26.91 
 
 		 756 aa  160  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0719  hypothetical protein  25.08 
 
 		 787 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0554  hypothetical protein  27.88 
 
 		 823 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.195396  normal  0.0453352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  38.67 
 
 		 1103 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  35.44 
 
 		 1064 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 		 1105 aa  78.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  50 
 
 		 1012 aa  77.8  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  46.07 
 
 		 1172 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  41.88 
 
 		 1059 aa  77.4  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  36.89 
 
 		 988 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1153 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 1166 aa  75.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1142 aa  75.5  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 1011 aa  75.5  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  37.18 
 
 		 1074 aa  75.1  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1051 aa  74.7  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  35.1 
 
 		 1038 aa  74.7  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  41.9 
 
 		 1035 aa  73.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  34.97 
 
 		 1021 aa  73.9  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  36.57 
 
 		 1148 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  34.2 
 
 		 1106 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1028 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  40.91 
 
 		 1124 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1040 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  40.29 
 
 		 1010 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  36.29 
 
 		 1079 aa  73.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  32.68 
 
 		 1147 aa  72.8  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  36.72 
 
 		 1047 aa  72.8  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  43.27 
 
 		 975 aa  71.6  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 		 1088 aa  72  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  47.31 
 
 		 989 aa  71.6  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  28.8 
 
 		 1071 aa  71.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  45.92 
 
 		 1008 aa  71.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  36.75 
 
 		 1140 aa  71.6  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 1043 aa  72  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  48.45 
 
 		 982 aa  71.2  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1434  hypothetical protein  29.01 
 
 		 575 aa  71.6  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1137 aa  71.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  36.57 
 
 		 1114 aa  71.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  40.71 
 
 		 1117 aa  71.2  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  41.44 
 
 		 1023 aa  70.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  34.64 
 
 		 1071 aa  70.9  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  38.33 
 
 		 1119 aa  70.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  36.3 
 
 		 1065 aa  70.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 1081 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  31.46 
 
 		 1058 aa  70.5  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  33.76 
 
 		 1023 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 		 1073 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  35.82 
 
 		 1127 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  36.71 
 
 		 1095 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  34.46 
 
 		 1103 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  36.11 
 
 		 1096 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  37.82 
 
 		 1161 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  42.71 
 
 		 1163 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 1022 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  48.39 
 
 		 1164 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 1160 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  42.71 
 
 		 1132 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1038 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6126  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 986 aa  70.1  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  42.42 
 
 		 1033 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  34.46 
 
 		 1065 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1176 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 1041 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  37.4 
 
 		 1003 aa  69.3  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1040 aa  69.3  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  42.45 
 
 		 1036 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  40.54 
 
 		 1039 aa  69.3  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  42.86 
 
 		 1006 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  34.92 
 
 		 1129 aa  69.3  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 993 aa  68.6  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  40.62 
 
 		 1028 aa  68.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  42.31 
 
 		 1122 aa  68.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  34.24 
 
 		 971 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  31.61 
 
 		 1028 aa  68.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  43.01 
 
 		 1008 aa  68.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  37.61 
 
 		 1111 aa  68.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  40.91 
 
 		 1198 aa  68.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  43.4 
 
 		 1177 aa  68.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  35.2 
 
 		 1050 aa  68.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1059 aa  68.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 1155 aa  68.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  41.12 
 
 		 1101 aa  68.2  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  39.45 
 
 		 1084 aa  68.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  34.97 
 
 		 1032 aa  67.8  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  34.25 
 
 		 1011 aa  68.2  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1152 aa  67.8  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>