18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4404 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4404  hypothetical protein  100 
 
 		 798 aa  1653    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1225  hypothetical protein  42.39 
 
 		 801 aa  647    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623353  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3208  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 823 aa  305  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00709825  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3041  hypothetical protein  28.39 
 
 		 822 aa  263  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.229998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3771  TonB-dependent receptor plug  33.48 
 
 		 810 aa  259  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 1182 aa  220  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5846  hypothetical protein  31.89 
 
 		 817 aa  212  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4550  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 1192 aa  207  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0226  hypothetical protein  28.01 
 
 		 897 aa  205  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5019  hypothetical protein  29.87 
 
 		 815 aa  204  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351905  normal  0.0490542 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2457  hypothetical protein  25.98 
 
 		 756 aa  137  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0469  hypothetical protein  30.42 
 
 		 908 aa  132  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2372  hypothetical protein  23.79 
 
 		 918 aa  131  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0691325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1434  hypothetical protein  27.86 
 
 		 575 aa  115  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  27.34 
 
 		 1411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08741  hypothetical protein  22.47 
 
 		 558 aa  93.2  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0719  hypothetical protein  33.09 
 
 		 787 aa  72.4  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0554  hypothetical protein  27.08 
 
 		 823 aa  64.3  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.195396  normal  0.0453352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>