More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3734 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3734  hypothetical protein  100 
 
 		 849 aa  1751    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  33.22 
 
 		 816 aa  423  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  33.14 
 
 		 829 aa  409  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  32.54 
 
 		 828 aa  403  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0263  hypothetical protein  28.69 
 
 		 905 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0236828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3079  hypothetical protein  26.64 
 
 		 930 aa  240  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0337116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2695  hypothetical protein  32.33 
 
 		 854 aa  172  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2875  hypothetical protein  23.79 
 
 		 843 aa  154  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2647  hypothetical protein  23.12 
 
 		 839 aa  145  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1641  hypothetical protein  22.39 
 
 		 853 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819235  normal  0.0314988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3440  hypothetical protein  22.64 
 
 		 853 aa  127  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3158  hypothetical protein  21.79 
 
 		 857 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  21.58 
 
 		 828 aa  107  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1476  hypothetical protein  21.87 
 
 		 841 aa  106  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1102  hypothetical protein  23.43 
 
 		 925 aa  102  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.778272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2403  hypothetical protein  24.92 
 
 		 848 aa  82.8  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  25.23 
 
 		 856 aa  82.4  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1525  hypothetical protein  24.76 
 
 		 855 aa  77.8  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0931717  normal  0.114595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 		 988 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1036 aa  75.5  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1059 aa  71.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 833 aa  71.6  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  37.5 
 
 		 803 aa  68.2  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  34.96 
 
 		 1148 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  39.05 
 
 		 1124 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  37.65 
 
 		 1024 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 		 922 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  36.28 
 
 		 1033 aa  64.7  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  41.18 
 
 		 1100 aa  64.7  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  45.35 
 
 		 1175 aa  64.7  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  37.27 
 
 		 795 aa  64.3  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  38.37 
 
 		 1075 aa  64.3  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  41.18 
 
 		 1076 aa  64.3  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  39 
 
 		 971 aa  64.3  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1076 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 1047 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 1050 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  40.66 
 
 		 1103 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  41.18 
 
 		 1128 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  38.37 
 
 		 1155 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 927 aa  63.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  43.02 
 
 		 1026 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 1165 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  38.2 
 
 		 1008 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 735 aa  62.4  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 982 aa  62.4  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1137 aa  62  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  39.36 
 
 		 753 aa  61.6  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  25 
 
 		 780 aa  62  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  37.27 
 
 		 789 aa  61.6  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1135 aa  61.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 1125 aa  61.6  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  41.18 
 
 		 791 aa  61.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1102 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 791 aa  61.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  38.37 
 
 		 1144 aa  61.2  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 1082 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  33.6 
 
 		 1142 aa  60.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  33.94 
 
 		 791 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 1071 aa  60.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 		 783 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  35.45 
 
 		 807 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  39.56 
 
 		 1034 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  32.82 
 
 		 1059 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  38.82 
 
 		 1181 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  33.98 
 
 		 1064 aa  59.7  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  38.82 
 
 		 1128 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0811  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 1016 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000353149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 		 1081 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  36.19 
 
 		 1063 aa  58.9  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1155 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 1087 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  36.47 
 
 		 1096 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  34.04 
 
 		 1023 aa  58.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 943 aa  58.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 1087 aa  58.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1117 aa  58.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  38.95 
 
 		 1105 aa  58.5  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 787 aa  58.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 814 aa  58.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  33.02 
 
 		 769 aa  57.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  36.67 
 
 		 1188 aa  57.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  30.59 
 
 		 872 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 		 1038 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 1105 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 1041 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  35.58 
 
 		 1010 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 		 1020 aa  57  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  34.12 
 
 		 1148 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  35.35 
 
 		 1051 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 958 aa  56.6  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 817 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 924 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  23.39 
 
 		 1043 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  33.72 
 
 		 1079 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  42.05 
 
 		 1152 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 1039 aa  57  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 1072 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  40.45 
 
 		 1011 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 		 1075 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>