More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5669 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  63.4 
 
 
806 aa  1071    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  57.82 
 
 
804 aa  891    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 
789 aa  1641    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  41.68 
 
 
874 aa  608  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  38.62 
 
 
875 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  37.56 
 
 
775 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  37.7 
 
 
772 aa  538  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  38.31 
 
 
881 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  36.16 
 
 
775 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  37.75 
 
 
772 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  35.56 
 
 
792 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  36.29 
 
 
787 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  36.89 
 
 
814 aa  479  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  34.32 
 
 
790 aa  466  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  33.85 
 
 
800 aa  457  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 
793 aa  456  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 
791 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  33.73 
 
 
780 aa  446  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  34.27 
 
 
923 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 
852 aa  418  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 
923 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  33.67 
 
 
753 aa  396  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  30.88 
 
 
872 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  30.54 
 
 
928 aa  360  6e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  31.03 
 
 
917 aa  354  2.9999999999999997e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 
791 aa  347  6e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 
756 aa  341  4e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  28.76 
 
 
803 aa  328  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 
786 aa  322  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 
800 aa  315  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 
831 aa  268  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  27.91 
 
 
888 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  22.81 
 
 
866 aa  159  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  22.95 
 
 
906 aa  121  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  23.99 
 
 
865 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  25.22 
 
 
860 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 
865 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 
814 aa  109  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  25.18 
 
 
859 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  23.98 
 
 
859 aa  104  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  27.12 
 
 
802 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  28.2 
 
 
821 aa  96.3  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  23.55 
 
 
821 aa  95.5  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  22.69 
 
 
797 aa  95.1  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  22.16 
 
 
779 aa  93.6  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 
897 aa  93.2  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 
730 aa  92.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  22.81 
 
 
791 aa  92.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 
771 aa  89  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 
1089 aa  87.8  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  19.97 
 
 
902 aa  87.4  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  25.44 
 
 
767 aa  85.5  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  21.42 
 
 
897 aa  81.6  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  27.89 
 
 
827 aa  80.9  0.00000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 
1060 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 
1117 aa  78.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 
1050 aa  78.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  27.46 
 
 
874 aa  77.8  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 
1087 aa  77.4  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 
1062 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 
966 aa  76.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 
1082 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.44 
 
 
1161 aa  75.5  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  23.74 
 
 
719 aa  75.1  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 
935 aa  75.1  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 
1062 aa  74.7  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  22.14 
 
 
800 aa  73.9  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 
1173 aa  73.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  35.4 
 
 
1021 aa  73.2  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 
1047 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 
982 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 
924 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 
1148 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 
952 aa  72.4  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 
986 aa  72  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 
1085 aa  71.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  20.62 
 
 
777 aa  71.2  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 
1042 aa  71.2  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  34.39 
 
 
1114 aa  70.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1856  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 
792 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.693128  normal  0.812872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  21.62 
 
 
701 aa  69.7  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 
993 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 
979 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 
1026 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  36.23 
 
 
1071 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 
1102 aa  69.3  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  26.26 
 
 
803 aa  68.6  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 
1064 aa  68.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 
1051 aa  68.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 
933 aa  68.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 
1006 aa  67.8  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0783  TonB-dependent receptor  21.24 
 
 
708 aa  67  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.285032  normal  0.0256294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4139  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 
1139 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.380719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 
1101 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 
1029 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 
1168 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 
1137 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  27.4 
 
 
848 aa  65.9  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  29.51 
 
 
1025 aa  65.5  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 
1080 aa  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>