More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0129 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  100 
 
 		 829 aa  1674    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  47.11 
 
 		 828 aa  767    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  34.22 
 
 		 816 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3734  hypothetical protein  33.14 
 
 		 849 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0263  hypothetical protein  25.45 
 
 		 905 aa  254  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0236828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3079  hypothetical protein  29.24 
 
 		 930 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0337116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2695  hypothetical protein  26.59 
 
 		 854 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  23.58 
 
 		 828 aa  152  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1641  hypothetical protein  22.42 
 
 		 853 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819235  normal  0.0314988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3440  hypothetical protein  24.04 
 
 		 853 aa  137  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2647  hypothetical protein  23.27 
 
 		 839 aa  131  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567832  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1102  hypothetical protein  20.73 
 
 		 925 aa  127  7e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.778272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3158  hypothetical protein  21.42 
 
 		 857 aa  114  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1525  hypothetical protein  25.9 
 
 		 855 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0931717  normal  0.114595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  24.83 
 
 		 856 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2875  hypothetical protein  21.97 
 
 		 843 aa  107  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2403  hypothetical protein  26.11 
 
 		 848 aa  104  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1476  hypothetical protein  21.85 
 
 		 841 aa  98.2  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04045  hypothetical protein  21.89 
 
 		 814 aa  80.9  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0576  hypothetical protein  25.78 
 
 		 831 aa  80.9  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  39.77 
 
 		 1103 aa  74.7  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  38.68 
 
 		 1102 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  40.7 
 
 		 1155 aa  72  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  39.05 
 
 		 1008 aa  71.6  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0788  hypothetical protein  19.95 
 
 		 877 aa  70.5  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  36.89 
 
 		 1056 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  36.45 
 
 		 735 aa  70.5  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  43.02 
 
 		 1100 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  36.79 
 
 		 1105 aa  68.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  41.05 
 
 		 1127 aa  68.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 		 1020 aa  68.2  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 1020 aa  67.4  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  36.45 
 
 		 1064 aa  67  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  43.82 
 
 		 1148 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  40.23 
 
 		 1127 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  38.95 
 
 		 1192 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  32.28 
 
 		 1021 aa  65.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  37.25 
 
 		 1033 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  36.05 
 
 		 1040 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  33.01 
 
 		 989 aa  65.5  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  37.21 
 
 		 1102 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  34.55 
 
 		 1010 aa  64.7  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  35.11 
 
 		 1107 aa  64.7  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1513  hypothetical protein  23.33 
 
 		 838 aa  64.7  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1181 aa  64.7  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 1137 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  36.54 
 
 		 1079 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 1076 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  38.37 
 
 		 1124 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1075 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  38.37 
 
 		 1034 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  34.48 
 
 		 1165 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  35.64 
 
 		 1024 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  38.78 
 
 		 1045 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1034 aa  63.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  34.26 
 
 		 1096 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  35.23 
 
 		 1153 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  40.7 
 
 		 1081 aa  62  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 1085 aa  62  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  40.23 
 
 		 1128 aa  62  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4095  TonB-dependent receptor, plug  27.47 
 
 		 1123 aa  62  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  38.3 
 
 		 874 aa  61.6  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 1058 aa  61.6  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  39.53 
 
 		 1026 aa  62  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 1155 aa  62  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  32.04 
 
 		 1019 aa  62  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10568  hypothetical protein  33.33 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0268859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  35.23 
 
 		 1098 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  34.26 
 
 		 1188 aa  61.6  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4475  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 955 aa  61.6  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 1101 aa  61.2  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  34.65 
 
 		 1028 aa  60.8  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 1038 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  36.05 
 
 		 1130 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  37.21 
 
 		 1148 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 1049 aa  60.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 998 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 887 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  33.94 
 
 		 1065 aa  60.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  37.93 
 
 		 1135 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1038 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 		 1144 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 1055 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  37.08 
 
 		 992 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 1080 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 988 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  34.51 
 
 		 1005 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  35.24 
 
 		 1137 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1139 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 		 1161 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  38.95 
 
 		 1095 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 1061 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  37.5 
 
 		 1027 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  33.94 
 
 		 769 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  37.21 
 
 		 1161 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  35.11 
 
 		 1046 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 1003 aa  59.3  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  35.24 
 
 		 1041 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  36.05 
 
 		 1012 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  36.78 
 
 		 1144 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>