47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10568 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10568  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  866    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0268859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.05 
 
 		 957 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2647  hypothetical protein  28.76 
 
 		 839 aa  63.2  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0576  hypothetical protein  31.84 
 
 		 831 aa  63.2  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  33.33 
 
 		 829 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  22.83 
 
 		 828 aa  56.2  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  33.04 
 
 		 828 aa  54.3  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1073 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1010 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  29.2 
 
 		 1019 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 		 1086 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0236  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 958 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1678  TonB-dependent receptor  38.37 
 
 		 751 aa  48.5  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04045  hypothetical protein  26.6 
 
 		 814 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 1036 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  33.03 
 
 		 1063 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0189  hypothetical protein  28.46 
 
 		 437 aa  47  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.562826 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  33.78 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  32.38 
 
 		 1028 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 1049 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  29.1 
 
 		 1043 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 		 1036 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  41.49 
 
 		 1023 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 792 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 922 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 1175 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1164 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  33.77 
 
 		 1024 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0185  ragA protein  39.51 
 
 		 1017 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.458513 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  25.66 
 
 		 833 aa  44.7  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  28.35 
 
 		 807 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1079 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 1071 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1071 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1130 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 1028 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2875  hypothetical protein  24 
 
 		 843 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1062 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 854 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1511  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 772 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  35.48 
 
 		 1139 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1059 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 1163 aa  43.1  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  30.4 
 
 		 1002 aa  43.1  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1641  hypothetical protein  27.33 
 
 		 853 aa  43.1  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819235  normal  0.0314988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2153  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 		 1042 aa  43.1  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607651  normal  0.711508 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  29.41 
 
 		 878 aa  43.1  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>