More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1678 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1451  TonB-dependent receptor  62.9 
 
 		 668 aa  882    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1678  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 751 aa  1558    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5685  TonB-dependent receptor  46.39 
 
 		 773 aa  601  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0785655  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3109  TonB-dependent receptor  42.8 
 
 		 745 aa  582  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.87493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1511  TonB-dependent receptor  38.6 
 
 		 772 aa  500  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 760 aa  209  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  25.36 
 
 		 748 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  25.06 
 
 		 753 aa  201  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  24.31 
 
 		 750 aa  150  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 733 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 734 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1905  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 713 aa  100  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86655  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  24.23 
 
 		 833 aa  95.9  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  27.69 
 
 		 848 aa  91.3  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  23.15 
 
 		 687 aa  84  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 1046 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  20.65 
 
 		 721 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  35.86 
 
 		 1094 aa  80.1  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3191  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 720 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126534  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 778 aa  79.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1053 aa  78.2  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  26.8 
 
 		 1237 aa  77.8  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 1079 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 1021 aa  77  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 		 1050 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  51.85 
 
 		 1128 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 1086 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  26.89 
 
 		 788 aa  75.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 874 aa  75.1  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0798  hypothetical protein  20.98 
 
 		 720 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 1047 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 735 aa  73.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 763 aa  72.4  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 		 1075 aa  71.2  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 1186 aa  70.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 1114 aa  70.1  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  22.97 
 
 		 691 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 854 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 958 aa  69.3  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 1076 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  28.8 
 
 		 1024 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 1045 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 1090 aa  68.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 1047 aa  68.6  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 1056 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 791 aa  68.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 1023 aa  68.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1076 aa  68.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  25.69 
 
 		 1095 aa  68.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  30.41 
 
 		 1129 aa  67.8  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 1117 aa  67.8  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2153  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1042 aa  67.8  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607651  normal  0.711508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  31.25 
 
 		 872 aa  67.8  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1056 aa  67.4  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0203  TonB-dependent receptor, plug  22 
 
 		 700 aa  67.4  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.583502  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  36.75 
 
 		 1033 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1082 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3092  TonB-dependent receptor, plug  20.4 
 
 		 726 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  30.5 
 
 		 1023 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  33.6 
 
 		 1051 aa  67  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 1077 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1119 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 999 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1106 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  41.86 
 
 		 1173 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 1095 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1138 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  41 
 
 		 1165 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 780 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1135 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  29.26 
 
 		 942 aa  65.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  30.51 
 
 		 914 aa  65.5  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 		 1100 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  38.27 
 
 		 1127 aa  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 929 aa  65.1  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  34.36 
 
 		 1028 aa  65.1  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  43.75 
 
 		 984 aa  65.1  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 815 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1155 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 998 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 779 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 962 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  45.68 
 
 		 1031 aa  64.7  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  34.53 
 
 		 1080 aa  64.7  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 757 aa  64.7  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  37.38 
 
 		 979 aa  64.7  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  42.5 
 
 		 1079 aa  64.7  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  36.67 
 
 		 1155 aa  64.7  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 1004 aa  64.3  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1219 aa  64.3  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 1102 aa  64.3  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  45 
 
 		 1096 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1114 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  40.38 
 
 		 1003 aa  63.5  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1008 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 1139 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  22.3 
 
 		 861 aa  63.9  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  42.86 
 
 		 1153 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 991 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 1033 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>