More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3092 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  61.98 
 
 		 721 aa  906    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3092  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 726 aa  1465    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 734 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 733 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0203  TonB-dependent receptor, plug  32.17 
 
 		 700 aa  291  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.583502  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  32.87 
 
 		 687 aa  279  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  32.55 
 
 		 691 aa  272  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  24.69 
 
 		 750 aa  149  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  25.19 
 
 		 748 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  24.69 
 
 		 753 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 763 aa  131  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  24.24 
 
 		 760 aa  124  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  27.53 
 
 		 848 aa  114  8.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 778 aa  114  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5685  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 773 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0785655  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 688 aa  103  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 694 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  25.6 
 
 		 639 aa  97.8  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 		 613 aa  97.1  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  23.75 
 
 		 833 aa  94.4  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2289  TonB-dependent receptor plug  21.59 
 
 		 719 aa  94  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1451  TonB-dependent receptor  22.13 
 
 		 668 aa  92  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  24.29 
 
 		 680 aa  91.7  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 649 aa  91.3  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  23.05 
 
 		 640 aa  91.3  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3191  TonB-dependent receptor  21.44 
 
 		 720 aa  89.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126534  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 		 679 aa  89  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0635  TonB-dependent receptor  21.4 
 
 		 720 aa  87.8  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3318  TonB-dependent receptor  21.51 
 
 		 720 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0798  hypothetical protein  21.4 
 
 		 720 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  25.3 
 
 		 817 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 757 aa  85.5  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  27.85 
 
 		 788 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  22.07 
 
 		 676 aa  82.4  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  22.53 
 
 		 647 aa  81.3  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  22.41 
 
 		 812 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 726 aa  78.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 634 aa  78.2  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 698 aa  77.4  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 698 aa  77.4  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 698 aa  77.4  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 714 aa  76.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  21.7 
 
 		 633 aa  76.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  22.79 
 
 		 656 aa  76.3  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7219  TonB-dependent receptor  21.03 
 
 		 698 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1905  TonB-dependent receptor  20.96 
 
 		 713 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86655  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 836 aa  75.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 845 aa  75.5  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 798 aa  74.7  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  22.44 
 
 		 666 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  20.59 
 
 		 653 aa  74.3  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5346  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 763 aa  74.3  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  22.44 
 
 		 666 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  22.14 
 
 		 653 aa  74.3  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  22.44 
 
 		 666 aa  74.3  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 769 aa  73.9  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.35 
 
 		 696 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  26.88 
 
 		 704 aa  73.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  23.35 
 
 		 696 aa  73.6  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3109  TonB-dependent receptor  19.95 
 
 		 745 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.87493 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1678  TonB-dependent receptor  20.91 
 
 		 751 aa  73.6  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  29.44 
 
 		 750 aa  72.8  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  22.31 
 
 		 666 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1486  TonB-dependent receptor, plug  21.74 
 
 		 677 aa  72.8  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243313  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.16 
 
 		 666 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 918 aa  73.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0993  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 735 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0663099  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 		 747 aa  72.4  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  22.73 
 
 		 789 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  20.73 
 
 		 665 aa  72  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 743 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  22.35 
 
 		 661 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 814 aa  71.6  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  24.5 
 
 		 736 aa  71.2  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 762 aa  71.2  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 791 aa  70.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  25.48 
 
 		 797 aa  70.9  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 737 aa  70.9  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3315  TonB-dependent receptor, plug  26.24 
 
 		 781 aa  70.5  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 		 662 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.76 
 
 		 647 aa  70.1  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 828 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  22.59 
 
 		 656 aa  70.5  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 680 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  21.23 
 
 		 757 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  22.2 
 
 		 663 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 1066 aa  69.3  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 828 aa  69.7  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  27.06 
 
 		 849 aa  70.1  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 764 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0074  heme receptor HutR  30.49 
 
 		 713 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0136209  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  32.53 
 
 		 712 aa  70.1  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1511  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 		 772 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 662 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  24.16 
 
 		 695 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 699 aa  69.3  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  23.5 
 
 		 791 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2028  TonB family protein  23.08 
 
 		 960 aa  68.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 833 aa  68.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 662 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>