63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1451 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1451  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 668 aa  1377    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1678  TonB-dependent receptor  62.9 
 
 		 751 aa  882    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5685  TonB-dependent receptor  47.26 
 
 		 773 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0785655  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3109  TonB-dependent receptor  41.5 
 
 		 745 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.87493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1511  TonB-dependent receptor  37.52 
 
 		 772 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  26.73 
 
 		 753 aa  190  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  24.14 
 
 		 760 aa  172  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  24.85 
 
 		 748 aa  158  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  24.02 
 
 		 750 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 733 aa  107  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1905  TonB-dependent receptor  21.38 
 
 		 713 aa  101  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86655  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 734 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3092  TonB-dependent receptor, plug  21.86 
 
 		 726 aa  88.2  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  22.05 
 
 		 687 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 688 aa  81.6  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  23.12 
 
 		 721 aa  80.9  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  23.61 
 
 		 691 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2289  TonB-dependent receptor plug  20.13 
 
 		 719 aa  68.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0203  TonB-dependent receptor, plug  23.68 
 
 		 700 aa  68.6  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.583502  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 634 aa  67.8  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 		 649 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  21.75 
 
 		 649 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  27.05 
 
 		 848 aa  65.1  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 		 662 aa  63.9  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 		 680 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  21.87 
 
 		 662 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  23.61 
 
 		 833 aa  63.5  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  21.87 
 
 		 662 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  22.54 
 
 		 640 aa  63.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  21.63 
 
 		 653 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  19.01 
 
 		 653 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 763 aa  56.6  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 657 aa  57  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  19.86 
 
 		 635 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0798  hypothetical protein  23.7 
 
 		 720 aa  56.6  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 951 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3318  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 720 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  21.23 
 
 		 648 aa  55.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3191  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 720 aa  55.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126534  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0635  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 720 aa  55.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  21.67 
 
 		 696 aa  55.1  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 652 aa  54.3  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  19.52 
 
 		 702 aa  52.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  23.12 
 
 		 698 aa  52.4  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 661 aa  52  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  22.02 
 
 		 572 aa  50.8  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  18.97 
 
 		 653 aa  50.8  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3225  TonB-dependent siderophore receptor  37.5 
 
 		 803 aa  50.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 634 aa  47.8  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25 
 
 		 653 aa  47.4  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 778 aa  47.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  20 
 
 		 680 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  24.32 
 
 		 696 aa  46.2  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 981 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 967 aa  45.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 795 aa  45.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 727 aa  44.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  20.51 
 
 		 707 aa  44.7  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25.5 
 
 		 696 aa  44.3  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25.5 
 
 		 696 aa  44.3  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  21.75 
 
 		 666 aa  44.3  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 722 aa  43.9  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  21.34 
 
 		 621 aa  43.9  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>