110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5685 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5685  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 773 aa  1601    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0785655  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3109  TonB-dependent receptor  49.54 
 
 		 745 aa  621  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.87493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1451  TonB-dependent receptor  47.26 
 
 		 668 aa  605  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1678  TonB-dependent receptor  46.39 
 
 		 751 aa  601  1e-170  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1511  TonB-dependent receptor  43.83 
 
 		 772 aa  535  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 760 aa  207  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 753 aa  197  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 748 aa  188  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  26.94 
 
 		 750 aa  167  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1905  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 713 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86655  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6730  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 733 aa  111  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.23656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3092  TonB-dependent receptor, plug  23.92 
 
 		 726 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 734 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3191  TonB-dependent receptor  20.3 
 
 		 720 aa  90.1  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126534  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3318  TonB-dependent receptor  20.47 
 
 		 720 aa  89.7  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0635  TonB-dependent receptor  20.47 
 
 		 720 aa  90.1  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0798  hypothetical protein  19.81 
 
 		 720 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  23.95 
 
 		 833 aa  85.9  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  22.94 
 
 		 687 aa  84  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1677  Heavy metal transport/detoxification protein  44.04 
 
 		 116 aa  83.6  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.172839  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1506  cation-transporting ATPase  39.82 
 
 		 120 aa  82.8  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000147666  normal  0.111213 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0203  TonB-dependent receptor, plug  22.37 
 
 		 700 aa  82  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.583502  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  24.12 
 
 		 721 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3324  hypothetical protein  38.6 
 
 		 154 aa  80.1  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 763 aa  77.8  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1452  heavy metal transport/detoxification protein  39.25 
 
 		 114 aa  77.4  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  22.27 
 
 		 691 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3055  hypothetical protein  36.94 
 
 		 116 aa  75.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.242531  decreased coverage  0.000503951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3064  hypothetical protein  35.4 
 
 		 283 aa  70.1  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1532  cation-transporting ATPase  34.45 
 
 		 114 aa  68.9  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00495755  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  26.04 
 
 		 848 aa  67.8  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1516  Heavy metal transport/detoxification protein  32.41 
 
 		 121 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0275841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 778 aa  64.7  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 618 aa  63.9  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  20.89 
 
 		 634 aa  63.5  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  20.25 
 
 		 1128 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  20.32 
 
 		 679 aa  62.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2289  TonB-dependent receptor plug  21.33 
 
 		 719 aa  61.6  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  20.8 
 
 		 707 aa  60.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 699 aa  59.3  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 		 649 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 649 aa  58.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  21.62 
 
 		 653 aa  58.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  21.34 
 
 		 661 aa  57.8  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  22.36 
 
 		 696 aa  57.4  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  22.35 
 
 		 662 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 688 aa  56.6  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  19.64 
 
 		 646 aa  55.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  22.35 
 
 		 662 aa  55.1  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3112  Heavy metal transport/detoxification protein  34.88 
 
 		 113 aa  54.7  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.533336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6226  Heavy metal transport/detoxification protein  34.86 
 
 		 123 aa  54.7  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  22.18 
 
 		 680 aa  54.3  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  22.99 
 
 		 696 aa  54.3  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  22.14 
 
 		 662 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 842 aa  52.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7219  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 698 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 657 aa  52  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  20.24 
 
 		 613 aa  51.6  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 648 aa  51.6  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4648  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 653 aa  51.6  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  21.35 
 
 		 698 aa  51.6  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 707 aa  50.8  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 951 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1809  copper ion binding protein  40.91 
 
 		 75 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.865359  normal  0.918649 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 966 aa  49.7  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  21.41 
 
 		 706 aa  49.7  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  20.41 
 
 		 639 aa  49.3  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  23.03 
 
 		 652 aa  48.9  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 634 aa  48.1  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 757 aa  47.8  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.71 
 
 		 969 aa  47.8  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  19.79 
 
 		 614 aa  47.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  26.62 
 
 		 668 aa  47.8  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.26 
 
 		 653 aa  47  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 957 aa  47.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 686 aa  47  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 956 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  24.48 
 
 		 696 aa  47.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  19.79 
 
 		 614 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  19.79 
 
 		 614 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  26.7 
 
 		 860 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  20 
 
 		 611 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  25.18 
 
 		 617 aa  46.2  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  21.77 
 
 		 744 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 681 aa  46.2  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  22.95 
 
 		 634 aa  46.2  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  19.79 
 
 		 614 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25.48 
 
 		 696 aa  46.6  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  19.93 
 
 		 614 aa  45.8  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 947 aa  45.8  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  39.44 
 
 		 1196 aa  46.2  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  21.92 
 
 		 597 aa  45.8  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 647 aa  45.8  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  19.93 
 
 		 614 aa  45.8  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  19.9 
 
 		 614 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 946 aa  45.8  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  26.7 
 
 		 859 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2063  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 645 aa  45.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.785465  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  21.3 
 
 		 715 aa  45.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  20.04 
 
 		 614 aa  45.4  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>