36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3064 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3064  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  584  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0189  hypothetical protein  60.14 
 
 		 176 aa  191  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2295  hypothetical protein  44.29 
 
 		 160 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000219695  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3055  hypothetical protein  39.82 
 
 		 116 aa  95.5  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.242531  decreased coverage  0.000503951 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6867  hypothetical protein  36.91 
 
 		 163 aa  89.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.345533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3067  hypothetical protein  37.12 
 
 		 170 aa  89.4  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126961  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6818  hypothetical protein  36.67 
 
 		 158 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.982635 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0328  hypothetical protein  36.36 
 
 		 158 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3066  hypothetical protein  34.75 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.254164  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11738  hypothetical protein  31.58 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  35.92 
 
 		 561 aa  80.5  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.86 
 
 		 607 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.43 
 
 		 627 aa  79  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2052  hypothetical protein  33.1 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  hitchhiker  0.00461216 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1506  cation-transporting ATPase  43.27 
 
 		 120 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000147666  normal  0.111213 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11703  putative cation efflux system transmembrane protein  31.06 
 
 		 578 aa  73.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.728459  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2488  hypothetical protein  31.78 
 
 		 167 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3741  hypothetical protein  27.92 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0928658  hitchhiker  0.00292972 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1677  Heavy metal transport/detoxification protein  36.04 
 
 		 116 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.172839  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00535  hypothetical protein  29.66 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5685  TonB-dependent receptor  39.74 
 
 		 773 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0785655  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3049  hypothetical protein  30.5 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal  0.0155554 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3073  hypothetical protein  37.21 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3799  hypothetical protein  29.01 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.577173  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11373  hypothetical protein  30.15 
 
 		 174 aa  62  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2311  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.92 
 
 		 705 aa  60.8  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1532  cation-transporting ATPase  34.34 
 
 		 114 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00495755  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3324  hypothetical protein  34.18 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1516  Heavy metal transport/detoxification protein  32.11 
 
 		 121 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0275841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1452  heavy metal transport/detoxification protein  29.36 
 
 		 114 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  34.21 
 
 		 715 aa  52.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4413  hypothetical protein  34.57 
 
 		 179 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.445866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3112  Heavy metal transport/detoxification protein  32.11 
 
 		 113 aa  49.3  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.533336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6226  Heavy metal transport/detoxification protein  30.19 
 
 		 123 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.84 
 
 		 671 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  27.63 
 
 		 683 aa  42.7  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>