21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4413 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4413  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  356  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.445866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6818  hypothetical protein  32.3 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.982635 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3049  hypothetical protein  33.05 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal  0.0155554 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2311  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.33 
 
 		 705 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4421  hypothetical protein  39.68 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.454307  normal  0.20357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3073  hypothetical protein  34.71 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11373  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3064  hypothetical protein  34.57 
 
 		 283 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2488  hypothetical protein  29.69 
 
 		 167 aa  52  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6867  hypothetical protein  31.85 
 
 		 163 aa  51.2  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.345533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2052  hypothetical protein  32.46 
 
 		 177 aa  51.2  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  hitchhiker  0.00461216 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0189  hypothetical protein  37.33 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362437  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  26.72 
 
 		 561 aa  49.3  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11703  putative cation efflux system transmembrane protein  28.35 
 
 		 578 aa  49.3  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.728459  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3799  hypothetical protein  23.81 
 
 		 173 aa  48.5  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.577173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0328  hypothetical protein  31.48 
 
 		 158 aa  48.5  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  31.25 
 
 		 715 aa  48.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2295  hypothetical protein  28.79 
 
 		 160 aa  47.8  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000219695  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  33.72 
 
 		 683 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3067  hypothetical protein  25.45 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126961  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11738  hypothetical protein  27.41 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>