27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0328 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0328  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  314  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6818  hypothetical protein  79.11 
 
 		 158 aa  249  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.982635 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6867  hypothetical protein  71.78 
 
 		 163 aa  224  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.345533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2295  hypothetical protein  43.24 
 
 		 160 aa  110  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000219695  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11738  hypothetical protein  40.69 
 
 		 196 aa  105  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.54 
 
 		 627 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3049  hypothetical protein  41.86 
 
 		 187 aa  99  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal  0.0155554 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00535  hypothetical protein  37.67 
 
 		 181 aa  97.4  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3073  hypothetical protein  41.22 
 
 		 179 aa  96.7  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40 
 
 		 607 aa  93.6  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0189  hypothetical protein  39.39 
 
 		 176 aa  89.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362437  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11703  putative cation efflux system transmembrane protein  36.36 
 
 		 578 aa  89.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.728459  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3064  hypothetical protein  36.36 
 
 		 283 aa  88.2  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2052  hypothetical protein  36.64 
 
 		 177 aa  85.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  hitchhiker  0.00461216 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2311  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.38 
 
 		 705 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3066  hypothetical protein  36.03 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.254164  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11373  hypothetical protein  31.25 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3067  hypothetical protein  31.18 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126961  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  32.81 
 
 		 561 aa  76.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2488  hypothetical protein  33.58 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3799  hypothetical protein  34.35 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.577173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3741  hypothetical protein  28.78 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0928658  hitchhiker  0.00292972 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.36 
 
 		 671 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  38.89 
 
 		 683 aa  48.5  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4413  hypothetical protein  35.06 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.445866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  30.11 
 
 		 715 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4421  hypothetical protein  31.58 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.454307  normal  0.20357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>