27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6867 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6867  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  323  6e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.345533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6818  hypothetical protein  76.28 
 
 		 158 aa  236  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.982635 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0328  hypothetical protein  71.78 
 
 		 158 aa  209  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2295  hypothetical protein  40.54 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000219695  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11738  hypothetical protein  40.56 
 
 		 196 aa  103  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11703  putative cation efflux system transmembrane protein  38.81 
 
 		 578 aa  98.6  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.728459  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00535  hypothetical protein  38.46 
 
 		 181 aa  97.4  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3073  hypothetical protein  39.86 
 
 		 179 aa  96.7  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0189  hypothetical protein  35.33 
 
 		 176 aa  94.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362437  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3049  hypothetical protein  39.53 
 
 		 187 aa  94.4  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal  0.0155554 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40 
 
 		 627 aa  90.1  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3064  hypothetical protein  36.91 
 
 		 283 aa  89.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2052  hypothetical protein  40.46 
 
 		 177 aa  89  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  hitchhiker  0.00461216 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3066  hypothetical protein  37.58 
 
 		 230 aa  86.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.254164  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.55 
 
 		 607 aa  85.1  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3067  hypothetical protein  33.13 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126961  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  34.88 
 
 		 561 aa  82  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2311  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.62 
 
 		 705 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11373  hypothetical protein  33.07 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3741  hypothetical protein  30.66 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0928658  hitchhiker  0.00292972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2488  hypothetical protein  33.85 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3799  hypothetical protein  33.85 
 
 		 173 aa  70.5  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.577173  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.62 
 
 		 671 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  32.5 
 
 		 715 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  37.68 
 
 		 683 aa  45.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4413  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.445866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4421  hypothetical protein  35.94 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.454307  normal  0.20357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>