24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00535 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00535  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  373  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11373  hypothetical protein  37.36 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3073  hypothetical protein  35.29 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6818  hypothetical protein  39.57 
 
 		 158 aa  98.6  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.982635 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11738  hypothetical protein  34.76 
 
 		 196 aa  97.8  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6867  hypothetical protein  38.46 
 
 		 163 aa  97.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.345533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3049  hypothetical protein  33.51 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal  0.0155554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0328  hypothetical protein  37.67 
 
 		 158 aa  87.8  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2052  hypothetical protein  33.16 
 
 		 177 aa  86.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  hitchhiker  0.00461216 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11703  putative cation efflux system transmembrane protein  42.34 
 
 		 578 aa  81.3  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.728459  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  38.4 
 
 		 561 aa  77.4  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0189  hypothetical protein  32.32 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362437  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.79 
 
 		 607 aa  75.1  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.21 
 
 		 627 aa  75.1  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3066  hypothetical protein  37.27 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.254164  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3741  hypothetical protein  27.27 
 
 		 187 aa  72  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0928658  hitchhiker  0.00292972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2311  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.1 
 
 		 705 aa  68.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3067  hypothetical protein  29.53 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126961  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3064  hypothetical protein  29.66 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2295  hypothetical protein  38.55 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000219695  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.43 
 
 		 671 aa  61.6  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3799  hypothetical protein  29.77 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.577173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2488  hypothetical protein  37.84 
 
 		 167 aa  51.6  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  27.96 
 
 		 715 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>