24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2052 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2052  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  363  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  hitchhiker  0.00461216 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3049  hypothetical protein  33.15 
 
 		 187 aa  105  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal  0.0155554 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11373  hypothetical protein  30.86 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3073  hypothetical protein  30.3 
 
 		 179 aa  91.7  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  39.2 
 
 		 561 aa  89.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6867  hypothetical protein  40.46 
 
 		 163 aa  89  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.345533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00535  hypothetical protein  33.16 
 
 		 181 aa  86.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6818  hypothetical protein  39.69 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.982635 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0189  hypothetical protein  36.62 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362437  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11738  hypothetical protein  31.91 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0328  hypothetical protein  35.77 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3064  hypothetical protein  33.1 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11703  putative cation efflux system transmembrane protein  34.85 
 
 		 578 aa  78.6  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.728459  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2295  hypothetical protein  32.09 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000219695  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.03 
 
 		 607 aa  64.7  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3067  hypothetical protein  29.86 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126961  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.72 
 
 		 627 aa  61.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3799  hypothetical protein  28.77 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.577173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2488  hypothetical protein  29.05 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3741  hypothetical protein  31.51 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0928658  hitchhiker  0.00292972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2311  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.17 
 
 		 705 aa  57  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3066  hypothetical protein  28.19 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.254164  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.78 
 
 		 671 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4421  hypothetical protein  35.14 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.454307  normal  0.20357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>