21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4421 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4421  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  308  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.454307  normal  0.20357 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  27.85 
 
 		 561 aa  56.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4413  hypothetical protein  39.68 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.445866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6818  hypothetical protein  32.81 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.982635 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3073  hypothetical protein  30.19 
 
 		 179 aa  50.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2052  hypothetical protein  31.9 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  hitchhiker  0.00461216 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00535  hypothetical protein  25.86 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11373  hypothetical protein  23.95 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3049  hypothetical protein  30 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal  0.0155554 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6867  hypothetical protein  30.23 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.345533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 715 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0189  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362437  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4132  hypothetical protein  30.88 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.868447  normal  0.0158477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0328  hypothetical protein  31.58 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2488  hypothetical protein  29.41 
 
 		 167 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  32.73 
 
 		 683 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11703  putative cation efflux system transmembrane protein  34.29 
 
 		 578 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.728459  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3067  hypothetical protein  48.57 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126961  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3799  hypothetical protein  30.26 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.577173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3064  hypothetical protein  28.81 
 
 		 283 aa  41.2  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3066  hypothetical protein  48.57 
 
 		 230 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.254164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>