25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3049 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3049  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  386  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal  0.0155554 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3073  hypothetical protein  45.55 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2052  hypothetical protein  33.15 
 
 		 177 aa  105  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  hitchhiker  0.00461216 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.01 
 
 		 607 aa  104  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.46 
 
 		 627 aa  100  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6818  hypothetical protein  42.64 
 
 		 158 aa  95.5  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.982635 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6867  hypothetical protein  39.53 
 
 		 163 aa  94.4  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.345533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00535  hypothetical protein  33.51 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0328  hypothetical protein  52.5 
 
 		 158 aa  93.6  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11373  hypothetical protein  29.89 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11703  putative cation efflux system transmembrane protein  35.61 
 
 		 578 aa  79.7  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.728459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2311  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.43 
 
 		 705 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2295  hypothetical protein  30.92 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000219695  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  36.15 
 
 		 561 aa  77.4  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0189  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3741  hypothetical protein  41.43 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0928658  hitchhiker  0.00292972 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11738  hypothetical protein  29.8 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3066  hypothetical protein  32.7 
 
 		 230 aa  67.8  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.254164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3799  hypothetical protein  27.27 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.577173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3067  hypothetical protein  44.44 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126961  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3064  hypothetical protein  30.5 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.44 
 
 		 671 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2488  hypothetical protein  27.91 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4413  hypothetical protein  36.84 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.445866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  33.82 
 
 		 715 aa  45.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>