28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6818 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6818  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  313  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.982635 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6867  hypothetical protein  76.28 
 
 		 163 aa  236  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.345533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0328  hypothetical protein  79.11 
 
 		 158 aa  234  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11738  hypothetical protein  42.76 
 
 		 196 aa  110  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2295  hypothetical protein  41.22 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000219695  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00535  hypothetical protein  39.57 
 
 		 181 aa  98.6  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3049  hypothetical protein  42.64 
 
 		 187 aa  95.5  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal  0.0155554 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3073  hypothetical protein  51.25 
 
 		 179 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11703  putative cation efflux system transmembrane protein  37.88 
 
 		 578 aa  92  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.728459  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0189  hypothetical protein  40.15 
 
 		 176 aa  91.7  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362437  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3064  hypothetical protein  36.67 
 
 		 283 aa  88.6  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3066  hypothetical protein  38.97 
 
 		 230 aa  87.4  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.254164  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2052  hypothetical protein  39.69 
 
 		 177 aa  87  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  hitchhiker  0.00461216 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.44 
 
 		 607 aa  85.5  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11373  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  85.1  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.62 
 
 		 627 aa  84  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3067  hypothetical protein  34.86 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126961  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  32.81 
 
 		 561 aa  79  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2311  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.33 
 
 		 705 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3799  hypothetical protein  33.85 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.577173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2488  hypothetical protein  32.85 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3741  hypothetical protein  27.34 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0928658  hitchhiker  0.00292972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  33.78 
 
 		 715 aa  51.2  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.36 
 
 		 671 aa  48.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4413  hypothetical protein  35.62 
 
 		 179 aa  48.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.445866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  38.36 
 
 		 683 aa  48.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4421  hypothetical protein  28.92 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.454307  normal  0.20357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4132  hypothetical protein  37.68 
 
 		 217 aa  40.4  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.868447  normal  0.0158477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>