24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3741 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3741  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  390  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0928658  hitchhiker  0.00292972 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 		 607 aa  86.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.37 
 
 		 627 aa  82  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3073  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2295  hypothetical protein  27.74 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000219695  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3049  hypothetical protein  41.43 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal  0.0155554 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11373  hypothetical protein  24.72 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00535  hypothetical protein  27.27 
 
 		 181 aa  72  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6867  hypothetical protein  30.66 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.345533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3064  hypothetical protein  27.92 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0189  hypothetical protein  25.69 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362437  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2311  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.78 
 
 		 705 aa  65.1  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11703  putative cation efflux system transmembrane protein  28.38 
 
 		 578 aa  64.7  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.728459  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11738  hypothetical protein  23.08 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0328  hypothetical protein  30.69 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6818  hypothetical protein  27.34 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.982635 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2052  hypothetical protein  31.51 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  hitchhiker  0.00461216 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3067  hypothetical protein  36 
 
 		 170 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.89 
 
 		 671 aa  55.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  30.34 
 
 		 561 aa  54.7  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2488  hypothetical protein  24.24 
 
 		 167 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3799  hypothetical protein  25.74 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.577173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3066  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.254164  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  32.08 
 
 		 715 aa  49.3  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>