48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3066 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3066  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  474  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.254164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3067  hypothetical protein  75.86 
 
 		 170 aa  236  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126961  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11738  hypothetical protein  40.15 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6818  hypothetical protein  38.97 
 
 		 158 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.982635 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6867  hypothetical protein  37.58 
 
 		 163 aa  86.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.345533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0189  hypothetical protein  31.62 
 
 		 176 aa  84.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362437  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3064  hypothetical protein  34.75 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0328  hypothetical protein  36.76 
 
 		 158 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11703  putative cation efflux system transmembrane protein  31.43 
 
 		 578 aa  80.1  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.728459  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3073  hypothetical protein  35.97 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3799  hypothetical protein  37.32 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.577173  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00535  hypothetical protein  37.27 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2295  hypothetical protein  28.87 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000219695  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3049  hypothetical protein  32.7 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal  0.0155554 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  34.51 
 
 		 561 aa  66.2  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.89 
 
 		 607 aa  66.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.62 
 
 		 627 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2488  hypothetical protein  34.06 
 
 		 167 aa  62  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2311  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.03 
 
 		 705 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11373  hypothetical protein  26.58 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0164  hypothetical protein  43.02 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2052  hypothetical protein  28.19 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  hitchhiker  0.00461216 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1502  component of copper transport system  41.38 
 
 		 417 aa  55.5  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000118001  normal  0.0300718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4171  hypothetical protein  48.39 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0155  hypothetical protein  41.86 
 
 		 86 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.220155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0212  hypothetical protein  40.32 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4302  hypothetical protein  52.08 
 
 		 86 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1505  hypothetical protein  41.18 
 
 		 87 aa  53.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000185503  normal  0.10684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0151  copper-transporting ATPase domain-containing protein  52.08 
 
 		 86 aa  52.8  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101264  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4101  hypothetical protein  60.47 
 
 		 86 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3071  hypothetical protein  34.15 
 
 		 446 aa  52.8  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0195173  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3781  copper-transporting ATPase domain-containing protein  44.62 
 
 		 100 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.39 
 
 		 671 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3854  copper-transporting ATPase domain-containing protein  45.33 
 
 		 100 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3741  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0928658  hitchhiker  0.00292972 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3981  copper-transporting ATPase domain-containing protein  44.62 
 
 		 100 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3987  hypothetical protein  63.16 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4596  copper-transporting ATPase domain-containing protein  53.66 
 
 		 86 aa  48.5  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3473  hypothetical protein  38.81 
 
 		 116 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.92853  normal  0.888619 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0284  hypothetical protein  34.94 
 
 		 86 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3536  hypothetical protein  54.05 
 
 		 177 aa  45.1  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0191  hypothetical protein  37.66 
 
 		 138 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6878  RND family efflux transporter MFP subunit  35.21 
 
 		 473 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  28.79 
 
 		 404 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26 
 
 		 406 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1645  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  39.34 
 
 		 744 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.321264 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6823  RND family efflux transporter MFP subunit  27.23 
 
 		 485 aa  42.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  44.74 
 
 		 683 aa  41.6  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>