152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3536 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3536  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  353  5e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0212  hypothetical protein  55.19 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3987  hypothetical protein  45.63 
 
 		 204 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0191  hypothetical protein  46.67 
 
 		 138 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3473  hypothetical protein  43.75 
 
 		 116 aa  94.7  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.92853  normal  0.888619 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  33.52 
 
 		 872 aa  90.5  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  34.78 
 
 		 640 aa  87.8  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  44.19 
 
 		 810 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1587  copper/silver efflux P-type ATPase  38.68 
 
 		 814 aa  77  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.602341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1777  heavy metal translocating P-type ATPase  38.39 
 
 		 814 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0428003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3981  copper-transporting ATPase domain-containing protein  60.87 
 
 		 100 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3781  copper-transporting ATPase domain-containing protein  60.87 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3854  copper-transporting ATPase domain-containing protein  59.42 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0151  copper-transporting ATPase domain-containing protein  57.97 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101264  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  32.9 
 
 		 835 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4101  hypothetical protein  57.97 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4171  hypothetical protein  57.97 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4596  copper-transporting ATPase domain-containing protein  57.97 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  45.78 
 
 		 846 aa  71.2  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0164  hypothetical protein  56.52 
 
 		 86 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0155  hypothetical protein  55.07 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.220155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4302  hypothetical protein  53.62 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  34.45 
 
 		 822 aa  67.8  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2191  heavy metal translocating P-type ATPase  35 
 
 		 780 aa  64.3  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 		 502 aa  63.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  41.33 
 
 		 809 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0284  hypothetical protein  49.28 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  31.62 
 
 		 826 aa  61.6  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  34.95 
 
 		 781 aa  61.2  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  34.95 
 
 		 781 aa  61.2  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3474  heavy metal efflux system protein, putative  33.99 
 
 		 526 aa  60.5  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  31.01 
 
 		 773 aa  56.6  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3535  RND family efflux transporter MFP subunit  33.12 
 
 		 529 aa  55.5  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 502 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  31.53 
 
 		 500 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  35.29 
 
 		 767 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  45.1 
 
 		 815 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0243  heavy metal translocating P-type ATPase  38.74 
 
 		 833 aa  53.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.78 
 
 		 568 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  45.1 
 
 		 815 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4597  heavy metal efflux system protein, putative  33.04 
 
 		 472 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0277  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.13 
 
 		 627 aa  52.8  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  28.57 
 
 		 846 aa  52.4  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.14 
 
 		 772 aa  52  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  32.2 
 
 		 786 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  45.1 
 
 		 815 aa  52  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  36.84 
 
 		 806 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11723  heavy-metal transporting P-type ATPase  38.74 
 
 		 835 aa  51.6  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0439709  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.65 
 
 		 513 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0211  membrane-fusion protein-like protein  28.97 
 
 		 650 aa  51.2  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3782  RND family efflux transporter MFP subunit  30.09 
 
 		 502 aa  50.8  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  28.79 
 
 		 809 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0190  RND family efflux transporter MFP subunit  35.07 
 
 		 599 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7156  heavy metal translocating P-type ATPase  26.83 
 
 		 841 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.802165 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0191  heavy metal translocating P-type ATPase  36.27 
 
 		 837 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.562672  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5378  heavy metal translocating P-type ATPase  44.64 
 
 		 761 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.269135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2307  copper-translocating P-type ATPase  56.76 
 
 		 783 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4303  RND family efflux transporter MFP subunit  28.28 
 
 		 514 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  51.06 
 
 		 777 aa  49.3  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  46.67 
 
 		 816 aa  48.9  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0163  RND family efflux transporter MFP subunit  31.5 
 
 		 513 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0283  RND family efflux transporter MFP subunit  30.83 
 
 		 512 aa  48.9  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1836  heavy metal translocating P-type ATPase  34.09 
 
 		 794 aa  48.9  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  40.98 
 
 		 736 aa  48.5  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1849  heavy metal translocating P-type ATPase  29.91 
 
 		 762 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191422  hitchhiker  0.000000000440646 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1645  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  53.33 
 
 		 744 aa  48.5  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.321264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3972  heavy metal translocating P-type ATPase  31.13 
 
 		 782 aa  48.5  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16922  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  30.4 
 
 		 823 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0148  heavy metal translocating P-type ATPase  62.96 
 
 		 730 aa  48.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2544  heavy metal translocating P-type ATPase  31.82 
 
 		 787 aa  48.1  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.874956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0446  heavy metal translocating P-type ATPase  44 
 
 		 826 aa  48.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3074  heavy metal translocating P-type ATPase  37.37 
 
 		 845 aa  48.1  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  32.08 
 
 		 796 aa  48.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0154  heavy metal efflux protein, putative  28.12 
 
 		 513 aa  47.8  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.235604  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0180  copper-translocating P-type ATPase  30.28 
 
 		 801 aa  47.8  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  59.38 
 
 		 778 aa  47.8  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  30.61 
 
 		 1020 aa  47.8  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 746 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  35.48 
 
 		 504 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  32.1 
 
 		 801 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  53.12 
 
 		 831 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0150  RND family efflux transporter MFP subunit  30.36 
 
 		 509 aa  47.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0999403  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11368  heavy-metal transporting P-type ATPase  40.74 
 
 		 824 aa  47.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4172  RND family efflux transporter MFP subunit  28.81 
 
 		 513 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5360  heavy metal translocating P-type ATPase  40.68 
 
 		 797 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.647165  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  64.29 
 
 		 735 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1144  heavy metal translocating P-type ATPase  61.54 
 
 		 851 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0307276  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2153  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 724 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00626662  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  57.58 
 
 		 805 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  32.14 
 
 		 787 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  31.96 
 
 		 581 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2604  heavy metal translocating P-type ATPase  66.67 
 
 		 735 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  32.74 
 
 		 795 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2142  heavy metal translocating P-type ATPase  29.51 
 
 		 781 aa  45.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000033244  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0708  heavy metal translocating P-type ATPase  46.81 
 
 		 736 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1505  hypothetical protein  51.11 
 
 		 87 aa  45.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000185503  normal  0.10684 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  61.54 
 
 		 798 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  29.85 
 
 		 841 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903237  normal  0.0729123 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3066  hypothetical protein  54.05 
 
 		 230 aa  45.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.254164  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  26.83 
 
 		 793 aa  45.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>