112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3987 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3987  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  407  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0212  hypothetical protein  54.59 
 
 		 192 aa  191  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3536  hypothetical protein  44.66 
 
 		 177 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0191  hypothetical protein  48.92 
 
 		 138 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3473  hypothetical protein  46.58 
 
 		 116 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.92853  normal  0.888619 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  31.74 
 
 		 872 aa  85.5  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4302  hypothetical protein  55.41 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0151  copper-transporting ATPase domain-containing protein  47.96 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101264  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0164  hypothetical protein  55.41 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3781  copper-transporting ATPase domain-containing protein  57.33 
 
 		 100 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3981  copper-transporting ATPase domain-containing protein  57.33 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3854  copper-transporting ATPase domain-containing protein  54.79 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4171  hypothetical protein  54.05 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4101  hypothetical protein  53.42 
 
 		 86 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0155  hypothetical protein  52.7 
 
 		 86 aa  72  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.220155  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4596  copper-transporting ATPase domain-containing protein  56 
 
 		 86 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  30.97 
 
 		 810 aa  67.4  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1587  copper/silver efflux P-type ATPase  37.63 
 
 		 814 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.602341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1777  heavy metal translocating P-type ATPase  36.17 
 
 		 814 aa  66.2  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0428003 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  35.92 
 
 		 835 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0284  hypothetical protein  49.33 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  30.53 
 
 		 822 aa  62.8  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  33.66 
 
 		 809 aa  62.4  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0277  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.26 
 
 		 627 aa  60.8  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  35.23 
 
 		 846 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  28.93 
 
 		 502 aa  59.7  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  26.6 
 
 		 640 aa  58.2  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2191  heavy metal translocating P-type ATPase  34.34 
 
 		 780 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  32.97 
 
 		 826 aa  55.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3782  RND family efflux transporter MFP subunit  33.76 
 
 		 502 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3535  RND family efflux transporter MFP subunit  27.32 
 
 		 529 aa  54.7  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4597  heavy metal efflux system protein, putative  35.34 
 
 		 472 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0150  RND family efflux transporter MFP subunit  30.99 
 
 		 509 aa  52.4  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0999403  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.6 
 
 		 513 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  34.88 
 
 		 767 aa  51.6  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4172  RND family efflux transporter MFP subunit  29.46 
 
 		 513 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4303  RND family efflux transporter MFP subunit  29.46 
 
 		 514 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  29.73 
 
 		 846 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  31.61 
 
 		 500 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3474  heavy metal efflux system protein, putative  29.94 
 
 		 526 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3066  hypothetical protein  44.3 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.254164  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0190  RND family efflux transporter MFP subunit  26.04 
 
 		 599 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3533  heavy metal translocating P-type ATPase  30.08 
 
 		 786 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4609  heavy metal translocating P-type ATPase  30.08 
 
 		 786 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3972  heavy metal translocating P-type ATPase  30.36 
 
 		 782 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16922  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0163  RND family efflux transporter MFP subunit  28.8 
 
 		 513 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0283  RND family efflux transporter MFP subunit  29.45 
 
 		 512 aa  48.5  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  33.61 
 
 		 502 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2229  copper-translocating P-type ATPase  32.61 
 
 		 787 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0148  heavy metal translocating P-type ATPase  55.56 
 
 		 730 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  30.23 
 
 		 781 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  30.23 
 
 		 781 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  33.93 
 
 		 736 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1144  heavy metal translocating P-type ATPase  52.78 
 
 		 851 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0307276  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1505  hypothetical protein  38.46 
 
 		 87 aa  46.2  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000185503  normal  0.10684 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3071  hypothetical protein  33.94 
 
 		 446 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0195173  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  45.71 
 
 		 772 aa  45.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1223  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 721 aa  45.8  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0154  heavy metal efflux protein, putative  29.29 
 
 		 513 aa  45.1  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.235604  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  26.89 
 
 		 788 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1836  heavy metal translocating P-type ATPase  46.67 
 
 		 794 aa  44.7  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  48.65 
 
 		 841 aa  44.7  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903237  normal  0.0729123 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0180  copper-translocating P-type ATPase  29.37 
 
 		 801 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7156  heavy metal translocating P-type ATPase  48.65 
 
 		 841 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.802165 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.69 
 
 		 627 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2307  copper-translocating P-type ATPase  51.52 
 
 		 783 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  46.67 
 
 		 809 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 806 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  32.99 
 
 		 805 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  33.87 
 
 		 815 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1645  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  47.22 
 
 		 744 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.321264 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0211  membrane-fusion protein-like protein  24.73 
 
 		 650 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4130  copper-translocating P-type ATPase  46.67 
 
 		 799 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  34.55 
 
 		 737 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0708  heavy metal translocating P-type ATPase  42.55 
 
 		 736 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  40 
 
 		 735 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0268  hypothetical protein  36.36 
 
 		 105 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 815 aa  43.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  29.84 
 
 		 795 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 815 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 746 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  41.3 
 
 		 823 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  35.59 
 
 		 735 aa  42.4  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.85 
 
 		 607 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  42.22 
 
 		 801 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5360  heavy metal translocating P-type ATPase  68 
 
 		 797 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.647165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  42.22 
 
 		 818 aa  42.4  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  31.25 
 
 		 404 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5378  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 761 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.269135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 		 787 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  47.22 
 
 		 798 aa  42  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  47.22 
 
 		 778 aa  42  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3038  copper-translocating P-type ATPase  27.14 
 
 		 842 aa  42  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2054  copper-translocating P-type ATPase  27.14 
 
 		 842 aa  42  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860111  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2230  copper-translocating P-type ATPase  27.14 
 
 		 842 aa  42  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6878  RND family efflux transporter MFP subunit  48.98 
 
 		 473 aa  42  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 		 831 aa  42  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  51.52 
 
 		 755 aa  42  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  42.22 
 
 		 804 aa  41.6  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1804  heavy metal translocating P-type ATPase  59.26 
 
 		 806 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.75515 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>