More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3603 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3972  heavy metal translocating P-type ATPase  54.51 
 
 		 782 aa  788    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16922  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2599  heavy metal translocating P-type ATPase  56.53 
 
 		 836 aa  761    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.283973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  59.21 
 
 		 1020 aa  850    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 781 aa  1567    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2230  copper-translocating P-type ATPase  59.39 
 
 		 842 aa  769    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  60.11 
 
 		 715 aa  793    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0311  copper-translocating P-type ATPase  59.39 
 
 		 842 aa  755    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2229  copper-translocating P-type ATPase  54.71 
 
 		 787 aa  758    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0030  copper-translocating P-type ATPase  53.97 
 
 		 791 aa  760    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000836932 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  55.71 
 
 		 746 aa  758    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  58.48 
 
 		 787 aa  893    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3368  copper-translocating P-type ATPase  59.25 
 
 		 768 aa  769    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  57.05 
 
 		 735 aa  842    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  57.93 
 
 		 736 aa  847    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  57.1 
 
 		 735 aa  848    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1587  copper/silver efflux P-type ATPase  59.15 
 
 		 814 aa  910    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.602341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  53.7 
 
 		 772 aa  763    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  59.11 
 
 		 806 aa  869    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  56.71 
 
 		 786 aa  825    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0911  heavy metal translocating P-type ATPase  54.52 
 
 		 831 aa  807    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5378  heavy metal translocating P-type ATPase  53.03 
 
 		 761 aa  757    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.269135 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0506  copper-translocating P-type ATPase  59.39 
 
 		 807 aa  770    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  63.34 
 
 		 724 aa  890    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  48.33 
 
 		 831 aa  642    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  60.55 
 
 		 767 aa  897    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  58.77 
 
 		 795 aa  890    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2110  heavy metal translocating P-type ATPase  54.05 
 
 		 776 aa  810    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  59.41 
 
 		 872 aa  923    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1223  heavy metal translocating P-type ATPase  54.77 
 
 		 721 aa  817    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  58.45 
 
 		 809 aa  860    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2005  heavy metal translocating P-type ATPase  52.73 
 
 		 753 aa  729    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0385  heavy metal translocating P-type ATPase  60.34 
 
 		 729 aa  801    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.530219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0283  copper-translocating P-type ATPase  58.06 
 
 		 807 aa  744    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3871  heavy metal translocating P-type ATPase  54.99 
 
 		 908 aa  801    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2142  heavy metal translocating P-type ATPase  57.33 
 
 		 781 aa  811    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000033244  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1849  heavy metal translocating P-type ATPase  55.24 
 
 		 762 aa  790    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191422  hitchhiker  0.000000000440646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  56.96 
 
 		 816 aa  795    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1144  heavy metal translocating P-type ATPase  55.87 
 
 		 851 aa  790    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0307276  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  77.32 
 
 		 822 aa  1244    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  57.81 
 
 		 895 aa  825    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  54.56 
 
 		 796 aa  786    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2964  copper-translocating P-type ATPase  56.78 
 
 		 753 aa  791    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0148  heavy metal translocating P-type ATPase  55.6 
 
 		 730 aa  722    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1480  heavy metal translocating P-type ATPase  55.98 
 
 		 811 aa  814    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  59.24 
 
 		 788 aa  869    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  57.74 
 
 		 818 aa  876    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  56.5 
 
 		 801 aa  872    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  59.16 
 
 		 793 aa  862    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3434  heavy metal translocating P-type ATPase  56.27 
 
 		 833 aa  822    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1777  heavy metal translocating P-type ATPase  59.54 
 
 		 814 aa  907    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0428003 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  53.61 
 
 		 805 aa  771    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  55.15 
 
 		 846 aa  827    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  63.93 
 
 		 841 aa  858    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903237  normal  0.0729123 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2191  heavy metal translocating P-type ATPase  54.47 
 
 		 780 aa  814    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0029  copper-translocating P-type ATPase  53.97 
 
 		 795 aa  760    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.747408  normal  0.269109 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1836  heavy metal translocating P-type ATPase  55.7 
 
 		 794 aa  774    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  57.24 
 
 		 773 aa  844    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2453  heavy metal translocating P-type ATPase  58.21 
 
 		 765 aa  830    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2544  heavy metal translocating P-type ATPase  58.38 
 
 		 787 aa  885    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.874956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  56.94 
 
 		 831 aa  781    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541257 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3504  heavy metal translocating P-type ATPase  60.83 
 
 		 743 aa  820    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  58.19 
 
 		 823 aa  868    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4609  heavy metal translocating P-type ATPase  54.46 
 
 		 786 aa  778    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  63.77 
 
 		 846 aa  961    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1072  heavy metal translocating P-type ATPase  60.68 
 
 		 755 aa  857    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0191  heavy metal translocating P-type ATPase  48.84 
 
 		 837 aa  758    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.562672  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  61.1 
 
 		 755 aa  862    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0031  copper-translocating P-type ATPase  53.97 
 
 		 838 aa  759    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  57.53 
 
 		 815 aa  830    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0446  heavy metal translocating P-type ATPase  55.69 
 
 		 826 aa  785    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2307  copper-translocating P-type ATPase  57.11 
 
 		 783 aa  842    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1804  heavy metal translocating P-type ATPase  51.25 
 
 		 806 aa  724    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.75515 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3091  copper-translocating P-type ATPase  54.24 
 
 		 868 aa  768    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344658  normal  0.403922 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 781 aa  1567    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0180  copper-translocating P-type ATPase  70.03 
 
 		 801 aa  1040    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0206  copper-transporting P-type ATPase  56.05 
 
 		 821 aa  810    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3074  heavy metal translocating P-type ATPase  49.35 
 
 		 845 aa  735    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4100  heavy metal translocating P-type ATPase  57.12 
 
 		 785 aa  731    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0322653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  55.8 
 
 		 973 aa  822    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  57.53 
 
 		 815 aa  831    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0708  heavy metal translocating P-type ATPase  58.02 
 
 		 736 aa  788    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  51.5 
 
 		 786 aa  641    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  57.53 
 
 		 815 aa  830    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4130  copper-translocating P-type ATPase  59.63 
 
 		 799 aa  850    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1645  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  58.84 
 
 		 744 aa  792    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.321264 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2054  copper-translocating P-type ATPase  59.39 
 
 		 842 aa  769    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860111  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0324  copper-translocating P-type ATPase  59.39 
 
 		 842 aa  770    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245948  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2153  heavy metal translocating P-type ATPase  59.23 
 
 		 724 aa  822    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  59.69 
 
 		 809 aa  910    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  60.2 
 
 		 786 aa  824    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5360  heavy metal translocating P-type ATPase  54.91 
 
 		 797 aa  723    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.647165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  58.85 
 
 		 804 aa  884    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  54.46 
 
 		 798 aa  811    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  54.07 
 
 		 778 aa  803    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  61.31 
 
 		 737 aa  898    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  53.43 
 
 		 777 aa  770    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2604  heavy metal translocating P-type ATPase  55.99 
 
 		 735 aa  763    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  54.76 
 
 		 835 aa  827    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3038  copper-translocating P-type ATPase  59.25 
 
 		 842 aa  768    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  59.55 
 
 		 796 aa  853    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>