152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3781 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3781  copper-transporting ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 100 aa  207  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3981  copper-transporting ATPase domain-containing protein  96 
 
 		 100 aa  201  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3854  copper-transporting ATPase domain-containing protein  94 
 
 		 100 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0151  copper-transporting ATPase domain-containing protein  84.88 
 
 		 86 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101264  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0164  hypothetical protein  83.72 
 
 		 86 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4171  hypothetical protein  82.56 
 
 		 86 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4101  hypothetical protein  82.56 
 
 		 86 aa  150  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4302  hypothetical protein  80.23 
 
 		 86 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0155  hypothetical protein  80.23 
 
 		 86 aa  144  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.220155  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4596  copper-transporting ATPase domain-containing protein  90.41 
 
 		 86 aa  138  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0284  hypothetical protein  69.77 
 
 		 86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0212  hypothetical protein  54.05 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3473  hypothetical protein  56.34 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.92853  normal  0.888619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0191  hypothetical protein  43.82 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3536  hypothetical protein  53.73 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3987  hypothetical protein  56 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.97 
 
 		 406 aa  54.7  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  54.55 
 
 		 846 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1505  hypothetical protein  37.97 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000185503  normal  0.10684 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  41.67 
 
 		 502 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7156  heavy metal translocating P-type ATPase  52.63 
 
 		 841 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.802165 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3066  hypothetical protein  44.62 
 
 		 230 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.254164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3071  hypothetical protein  36.11 
 
 		 446 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0195173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  55.56 
 
 		 767 aa  51.6  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  41.38 
 
 		 822 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  51.35 
 
 		 777 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  44.23 
 
 		 715 aa  51.2  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0864  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.71 
 
 		 345 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  35.71 
 
 		 404 aa  50.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  54.29 
 
 		 841 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903237  normal  0.0729123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  56.41 
 
 		 810 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0708  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 736 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  52.78 
 
 		 778 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  45.28 
 
 		 835 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4597  heavy metal efflux system protein, putative  43.64 
 
 		 472 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  38.6 
 
 		 816 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1502  component of copper transport system  47.62 
 
 		 417 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000118001  normal  0.0300718 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3782  RND family efflux transporter MFP subunit  36.27 
 
 		 502 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1849  heavy metal translocating P-type ATPase  51.43 
 
 		 762 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191422  hitchhiker  0.000000000440646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  32.18 
 
 		 786 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2191  heavy metal translocating P-type ATPase  69.23 
 
 		 780 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 781 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.46 
 
 		 607 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0087  heavy metal translocating P-type ATPase  47.83 
 
 		 792 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.908745  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 781 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  43.4 
 
 		 736 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1223  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 721 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  41.3 
 
 		 809 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0148  heavy metal translocating P-type ATPase  38.81 
 
 		 730 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 746 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0446  heavy metal translocating P-type ATPase  45.83 
 
 		 826 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4100  heavy metal translocating P-type ATPase  52.94 
 
 		 785 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0322653  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  39.66 
 
 		 735 aa  47.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  51.28 
 
 		 772 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50 
 
 		 568 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50 
 
 		 526 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  54.29 
 
 		 805 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0268  hypothetical protein  38.16 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0283  RND family efflux transporter MFP subunit  39.19 
 
 		 512 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5378  heavy metal translocating P-type ATPase  58.82 
 
 		 761 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.269135 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  50 
 
 		 527 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  42.55 
 
 		 846 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  36.07 
 
 		 455 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1645  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  44.44 
 
 		 744 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.321264 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6823  RND family efflux transporter MFP subunit  46 
 
 		 485 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5360  heavy metal translocating P-type ATPase  54.05 
 
 		 797 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.647165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6878  RND family efflux transporter MFP subunit  41.82 
 
 		 473 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.18 
 
 		 627 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 737 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0154  heavy metal efflux protein, putative  41.82 
 
 		 513 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.235604  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3368  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 		 768 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1144  heavy metal translocating P-type ATPase  59.26 
 
 		 851 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0307276  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2964  copper-translocating P-type ATPase  42.55 
 
 		 753 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2453  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 765 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1836  heavy metal translocating P-type ATPase  45.24 
 
 		 794 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  56.67 
 
 		 798 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 		 872 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0385  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 729 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.530219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0283  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 807 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  51.43 
 
 		 806 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  38.36 
 
 		 502 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  44.74 
 
 		 815 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  52.5 
 
 		 500 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2153  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 724 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00626662  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  41.3 
 
 		 1020 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  41.82 
 
 		 640 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1072  heavy metal translocating P-type ATPase  41.3 
 
 		 755 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  54.29 
 
 		 809 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0029  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 795 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.747408  normal  0.269109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2604  heavy metal translocating P-type ATPase  37.84 
 
 		 735 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3972  heavy metal translocating P-type ATPase  65.38 
 
 		 782 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16922  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0030  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 791 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000836932 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0506  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 		 807 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  42.22 
 
 		 724 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2110  heavy metal translocating P-type ATPase  55.17 
 
 		 776 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  45.45 
 
 		 735 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3038  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 		 842 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1804  heavy metal translocating P-type ATPase  61.54 
 
 		 806 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.75515 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  40.35 
 
 		 796 aa  43.9  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  44.74 
 
 		 793 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>