91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3473 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3473  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  229  7.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.92853  normal  0.888619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0212  hypothetical protein  44.6 
 
 		 192 aa  99  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0191  hypothetical protein  40.91 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3987  hypothetical protein  46.58 
 
 		 204 aa  94  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3536  hypothetical protein  42.76 
 
 		 177 aa  84.3  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3981  copper-transporting ATPase domain-containing protein  56.34 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3781  copper-transporting ATPase domain-containing protein  56.34 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0151  copper-transporting ATPase domain-containing protein  54.93 
 
 		 86 aa  72  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101264  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3854  copper-transporting ATPase domain-containing protein  56.34 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4596  copper-transporting ATPase domain-containing protein  54.93 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0155  hypothetical protein  54.29 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.220155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4302  hypothetical protein  54.93 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0164  hypothetical protein  53.52 
 
 		 86 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3535  RND family efflux transporter MFP subunit  39.81 
 
 		 529 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4171  hypothetical protein  52.11 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4101  hypothetical protein  52.11 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  44 
 
 		 810 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0284  hypothetical protein  38.79 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  46.03 
 
 		 846 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  46.67 
 
 		 826 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  35.87 
 
 		 809 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  24.31 
 
 		 502 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0191  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 837 aa  54.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.562672  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3071  hypothetical protein  36.23 
 
 		 446 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0195173  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4597  heavy metal efflux system protein, putative  25.62 
 
 		 472 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  29.59 
 
 		 781 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  29.59 
 
 		 781 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11723  heavy-metal transporting P-type ATPase  34.31 
 
 		 835 aa  50.8  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0439709  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11368  heavy-metal transporting P-type ATPase  39.53 
 
 		 824 aa  51.2  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.66 
 
 		 607 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3074  heavy metal translocating P-type ATPase  40.74 
 
 		 845 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 500 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3782  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 		 502 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  32.58 
 
 		 640 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 502 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0211  membrane-fusion protein-like protein  32.76 
 
 		 650 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0190  RND family efflux transporter MFP subunit  34.23 
 
 		 599 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6878  RND family efflux transporter MFP subunit  45.45 
 
 		 473 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  31.63 
 
 		 786 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3066  hypothetical protein  38.81 
 
 		 230 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.254164  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  37.08 
 
 		 504 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3474  heavy metal efflux system protein, putative  39.39 
 
 		 526 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.5 
 
 		 627 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1777  heavy metal translocating P-type ATPase  29.41 
 
 		 814 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0428003 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  55.17 
 
 		 767 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0154  heavy metal efflux protein, putative  25.93 
 
 		 513 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.235604  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  51.61 
 
 		 404 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  29.79 
 
 		 872 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32 
 
 		 526 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1502  component of copper transport system  28.81 
 
 		 417 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000118001  normal  0.0300718 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  31.03 
 
 		 835 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2307  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 		 783 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6823  RND family efflux transporter MFP subunit  42.22 
 
 		 485 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  36.36 
 
 		 735 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  37.7 
 
 		 451 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3368  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 768 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2604  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 		 735 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1836  heavy metal translocating P-type ATPase  42.55 
 
 		 794 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1587  copper/silver efflux P-type ATPase  30.11 
 
 		 814 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.602341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2005  heavy metal translocating P-type ATPase  34.21 
 
 		 753 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1072  heavy metal translocating P-type ATPase  47.22 
 
 		 755 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 568 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  36.11 
 
 		 796 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0150  RND family efflux transporter MFP subunit  23.61 
 
 		 509 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0999403  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0268  hypothetical protein  32.84 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1505  hypothetical protein  32.43 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000185503  normal  0.10684 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1849  heavy metal translocating P-type ATPase  35 
 
 		 762 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191422  hitchhiker  0.000000000440646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 		 715 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  41.46 
 
 		 724 aa  41.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  34.94 
 
 		 773 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1223  heavy metal translocating P-type ATPase  55.56 
 
 		 721 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  33.33 
 
 		 561 aa  41.2  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  46.88 
 
 		 793 aa  41.2  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2964  copper-translocating P-type ATPase  36 
 
 		 753 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3384  Fis family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 547 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2230  copper-translocating P-type ATPase  32.31 
 
 		 842 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3038  copper-translocating P-type ATPase  32.31 
 
 		 842 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2054  copper-translocating P-type ATPase  32.31 
 
 		 842 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860111  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  46.88 
 
 		 1020 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  31.65 
 
 		 737 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2153  heavy metal translocating P-type ATPase  51.28 
 
 		 724 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00626662  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 772 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0311  copper-translocating P-type ATPase  32.31 
 
 		 842 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0506  copper-translocating P-type ATPase  32.31 
 
 		 807 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0324  copper-translocating P-type ATPase  32.31 
 
 		 842 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245948  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0030  copper-translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 791 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000836932 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.57 
 
 		 406 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0031  copper-translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 838 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0029  copper-translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 795 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.747408  normal  0.269109 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  38.46 
 
 		 735 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0385  heavy metal translocating P-type ATPase  37.78 
 
 		 729 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.530219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>