132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0155 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0155  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  176  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.220155  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0164  hypothetical protein  96.51 
 
 		 86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4171  hypothetical protein  93.02 
 
 		 86 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4302  hypothetical protein  90.7 
 
 		 86 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0573694 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4101  hypothetical protein  91.86 
 
 		 86 aa  163  8e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0151  copper-transporting ATPase domain-containing protein  83.72 
 
 		 86 aa  152  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101264  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3781  copper-transporting ATPase domain-containing protein  80.23 
 
 		 100 aa  144  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3981  copper-transporting ATPase domain-containing protein  77.91 
 
 		 100 aa  143  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3854  copper-transporting ATPase domain-containing protein  77.91 
 
 		 100 aa  141  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0284  hypothetical protein  70.93 
 
 		 86 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4596  copper-transporting ATPase domain-containing protein  78.08 
 
 		 86 aa  121  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3473  hypothetical protein  54.29 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.92853  normal  0.888619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0212  hypothetical protein  54.05 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0191  hypothetical protein  52.31 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3536  hypothetical protein  49.25 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3987  hypothetical protein  52.7 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.19 
 
 		 406 aa  54.7  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3066  hypothetical protein  41.86 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.254164  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7156  heavy metal translocating P-type ATPase  48.89 
 
 		 841 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.802165 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  54.05 
 
 		 767 aa  50.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  45.83 
 
 		 841 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903237  normal  0.0729123 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.71 
 
 		 607 aa  50.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  41.46 
 
 		 404 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0864  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.22 
 
 		 345 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1502  component of copper transport system  47.62 
 
 		 417 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000118001  normal  0.0300718 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  40 
 
 		 502 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0150  RND family efflux transporter MFP subunit  38.46 
 
 		 509 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0999403  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6878  RND family efflux transporter MFP subunit  43.64 
 
 		 473 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  51.43 
 
 		 846 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3782  RND family efflux transporter MFP subunit  40.98 
 
 		 502 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3071  hypothetical protein  35.62 
 
 		 446 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0195173  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1505  hypothetical protein  33.33 
 
 		 87 aa  47.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000185503  normal  0.10684 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 778 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1849  heavy metal translocating P-type ATPase  44 
 
 		 762 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191422  hitchhiker  0.000000000440646 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  36.21 
 
 		 872 aa  47  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  34.48 
 
 		 746 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 816 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2191  heavy metal translocating P-type ATPase  65.38 
 
 		 780 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0087  heavy metal translocating P-type ATPase  45.65 
 
 		 792 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.908745  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  45.95 
 
 		 777 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  43.18 
 
 		 805 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0268  hypothetical protein  34.21 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  47.37 
 
 		 786 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  47.62 
 
 		 500 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5378  heavy metal translocating P-type ATPase  39.29 
 
 		 761 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.269135 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4100  heavy metal translocating P-type ATPase  43.59 
 
 		 785 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0322653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 796 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  43.59 
 
 		 781 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  43.59 
 
 		 781 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  39.34 
 
 		 451 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 772 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  33.9 
 
 		 801 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.44 
 
 		 513 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.18 
 
 		 627 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  54.55 
 
 		 835 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0446  heavy metal translocating P-type ATPase  61.54 
 
 		 826 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11723  heavy-metal transporting P-type ATPase  42.5 
 
 		 835 aa  44.3  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0439709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  32.76 
 
 		 455 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  37.93 
 
 		 798 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0191  heavy metal translocating P-type ATPase  58.82 
 
 		 837 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.562672  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0148  heavy metal translocating P-type ATPase  45.71 
 
 		 730 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  47.22 
 
 		 715 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5360  heavy metal translocating P-type ATPase  39.29 
 
 		 797 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.647165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  58.06 
 
 		 810 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  39.13 
 
 		 815 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3368  copper-translocating P-type ATPase  41.03 
 
 		 768 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  48.48 
 
 		 846 aa  43.5  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2604  heavy metal translocating P-type ATPase  34.67 
 
 		 735 aa  43.5  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1645  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  61.54 
 
 		 744 aa  43.5  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.321264 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1223  heavy metal translocating P-type ATPase  53.85 
 
 		 721 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1144  heavy metal translocating P-type ATPase  45.71 
 
 		 851 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0307276  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  48.57 
 
 		 806 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  51.43 
 
 		 826 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0283  RND family efflux transporter MFP subunit  36.49 
 
 		 512 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  38.3 
 
 		 737 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0385  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 729 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.530219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  38.18 
 
 		 1020 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3972  heavy metal translocating P-type ATPase  43.18 
 
 		 782 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16922  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  46.51 
 
 		 831 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541257 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4597  heavy metal efflux system protein, putative  42.86 
 
 		 472 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  38.78 
 
 		 735 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0506  copper-translocating P-type ATPase  41.03 
 
 		 807 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1779  secretion protein HlyD  39.66 
 
 		 427 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0975048  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  40.35 
 
 		 796 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2453  heavy metal translocating P-type ATPase  39.13 
 
 		 765 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3038  copper-translocating P-type ATPase  41.03 
 
 		 842 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2054  copper-translocating P-type ATPase  41.03 
 
 		 842 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860111  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0163  RND family efflux transporter MFP subunit  51.43 
 
 		 513 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0311  copper-translocating P-type ATPase  41.03 
 
 		 842 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0324  copper-translocating P-type ATPase  41.03 
 
 		 842 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2230  copper-translocating P-type ATPase  41.03 
 
 		 842 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0206  copper-transporting P-type ATPase  45.24 
 
 		 821 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4172  RND family efflux transporter MFP subunit  51.43 
 
 		 513 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  36.21 
 
 		 793 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4303  RND family efflux transporter MFP subunit  51.43 
 
 		 514 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6823  RND family efflux transporter MFP subunit  42.22 
 
 		 485 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  48.57 
 
 		 755 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1804  heavy metal translocating P-type ATPase  45.71 
 
 		 806 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.75515 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  37.74 
 
 		 724 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2110  heavy metal translocating P-type ATPase  51.72 
 
 		 776 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>