51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3324 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3324  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  304  3e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1506  cation-transporting ATPase  54.87 
 
 		 120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000147666  normal  0.111213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3055  hypothetical protein  43.24 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.242531  decreased coverage  0.000503951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1452  heavy metal transport/detoxification protein  37.27 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5685  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 773 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0785655  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3112  Heavy metal transport/detoxification protein  31.19 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.533336 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1532  cation-transporting ATPase  35.29 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00495755  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1516  Heavy metal transport/detoxification protein  33.66 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0275841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1677  Heavy metal transport/detoxification protein  33.04 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.172839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6226  Heavy metal transport/detoxification protein  32.14 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3064  hypothetical protein  31.87 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  40.28 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  39.73 
 
 		 942 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1665  heavy metal translocating P-type ATPase  33.9 
 
 		 774 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000242647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  32.43 
 
 		 826 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  34.25 
 
 		 831 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  32.1 
 
 		 750 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  35.21 
 
 		 817 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 802 aa  45.1  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2900  heavy metal translocating P-type ATPase  32.43 
 
 		 795 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0179481  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  31.08 
 
 		 794 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  36.92 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  34.29 
 
 		 821 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 836 aa  44.3  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  34.33 
 
 		 837 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  34.33 
 
 		 806 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 1087 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  30.56 
 
 		 820 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 786 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  35.48 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  31.08 
 
 		 806 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 806 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  38.67 
 
 		 835 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 836 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  32.84 
 
 		 805 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  29.17 
 
 		 799 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  32.84 
 
 		 805 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  32.84 
 
 		 805 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  37.88 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  32.84 
 
 		 805 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  32.84 
 
 		 805 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  32.84 
 
 		 805 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  32.84 
 
 		 805 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  33.82 
 
 		 821 aa  41.2  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  32.79 
 
 		 837 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 976 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  30.99 
 
 		 866 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3058  copper-translocating P-type ATPase  34.48 
 
 		 740 aa  40.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  38.98 
 
 		 838 aa  40  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  35.94 
 
 		 833 aa  40.4  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  35.82 
 
 		 77 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>