More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2170 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  51.76 
 
 		 821 aa  710    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  45.81 
 
 		 796 aa  657    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  46.67 
 
 		 828 aa  665    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  47.94 
 
 		 742 aa  669    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  47.77 
 
 		 794 aa  696    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  51.37 
 
 		 815 aa  648    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  48.49 
 
 		 805 aa  705    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  47.68 
 
 		 740 aa  667    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  47.44 
 
 		 826 aa  683    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  46.2 
 
 		 798 aa  643    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  48.82 
 
 		 805 aa  685    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  48.75 
 
 		 805 aa  681    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  48.95 
 
 		 805 aa  687    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  52.63 
 
 		 836 aa  778    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  47.82 
 
 		 786 aa  691    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  48.56 
 
 		 833 aa  667    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  45.37 
 
 		 760 aa  647    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  43.98 
 
 		 772 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  50.52 
 
 		 797 aa  722    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  47.78 
 
 		 954 aa  667    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  48.33 
 
 		 781 aa  654    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  53.06 
 
 		 753 aa  780    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  53.12 
 
 		 724 aa  639    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  49.54 
 
 		 834 aa  675    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  52.11 
 
 		 767 aa  662    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  48.75 
 
 		 806 aa  688    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  48.34 
 
 		 762 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  48.82 
 
 		 805 aa  685    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1223  heavy metal translocating P-type ATPase  47.81 
 
 		 721 aa  639    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  53.16 
 
 		 747 aa  744    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  46.28 
 
 		 796 aa  659    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0270  copper-translocating P-type ATPase  46.37 
 
 		 748 aa  638    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  47.19 
 
 		 857 aa  689    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  52.76 
 
 		 804 aa  666    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3496  copper-translocating P-type ATPase  51.02 
 
 		 805 aa  682    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  47.07 
 
 		 836 aa  648    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  47.17 
 
 		 793 aa  677    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  51.37 
 
 		 815 aa  648    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  54.24 
 
 		 755 aa  668    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  45.38 
 
 		 816 aa  665    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  48.33 
 
 		 781 aa  654    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  49.55 
 
 		 822 aa  635    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  45.68 
 
 		 895 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  45.06 
 
 		 796 aa  656    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  47.06 
 
 		 1020 aa  663    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  45.94 
 
 		 942 aa  664    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4130  copper-translocating P-type ATPase  46.14 
 
 		 799 aa  650    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  47.57 
 
 		 841 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  52.78 
 
 		 818 aa  654    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  52.7 
 
 		 801 aa  652    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  47.72 
 
 		 802 aa  682    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  47.07 
 
 		 836 aa  648    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  50.91 
 
 		 837 aa  699    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  50.72 
 
 		 840 aa  696    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  45.03 
 
 		 846 aa  661    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  50.59 
 
 		 838 aa  714    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3091  copper-translocating P-type ATPase  46.35 
 
 		 868 aa  640    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344658  normal  0.403922 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  49.05 
 
 		 836 aa  729    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  48.89 
 
 		 833 aa  670    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  51.7 
 
 		 759 aa  726    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  44.77 
 
 		 773 aa  640    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  46.38 
 
 		 795 aa  680    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2544  heavy metal translocating P-type ATPase  52.27 
 
 		 787 aa  641    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.874956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  49.22 
 
 		 743 aa  703    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  52.58 
 
 		 751 aa  688    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  46.32 
 
 		 750 aa  663    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  46.29 
 
 		 846 aa  672    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  50.4 
 
 		 855 aa  689    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1499  cation-transporting ATPase; copper-exporting ATPase  47.47 
 
 		 804 aa  657    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.037718  normal  0.0386539 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  48.22 
 
 		 889 aa  702    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  48.88 
 
 		 889 aa  710    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  51.57 
 
 		 758 aa  738    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  47.67 
 
 		 821 aa  648    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0446  heavy metal translocating P-type ATPase  44.38 
 
 		 826 aa  648    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  47.97 
 
 		 839 aa  682    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2599  heavy metal translocating P-type ATPase  46.81 
 
 		 836 aa  638    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.283973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  45.94 
 
 		 885 aa  700    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  47.72 
 
 		 802 aa  682    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  50.32 
 
 		 814 aa  696    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  47.26 
 
 		 778 aa  657    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  51.06 
 
 		 815 aa  645    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  48.61 
 
 		 762 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  73.53 
 
 		 786 aa  1166    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  49.47 
 
 		 803 aa  679    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  47.84 
 
 		 759 aa  677    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  48.55 
 
 		 827 aa  676    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  54.39 
 
 		 928 aa  639    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  50.66 
 
 		 1071 aa  656    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  47.25 
 
 		 747 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  47.59 
 
 		 828 aa  671    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  45.78 
 
 		 844 aa  683    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  46.45 
 
 		 809 aa  688    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  52.27 
 
 		 787 aa  650    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  47.96 
 
 		 838 aa  640    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  49.28 
 
 		 852 aa  689    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  44.54 
 
 		 798 aa  658    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  45.28 
 
 		 778 aa  662    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  49.34 
 
 		 833 aa  683    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  48.47 
 
 		 762 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  48.69 
 
 		 827 aa  684    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>