More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1381 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00435  copper transporter  46.89 
 
 
834 aa  748    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  46.89 
 
 
834 aa  748    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  42.35 
 
 
828 aa  641    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  47.93 
 
 
833 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
827 aa  655    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  49.62 
 
 
804 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2072  copper-translocating P-type ATPase  52.05 
 
 
725 aa  721    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  43.57 
 
 
805 aa  643    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  41.85 
 
 
826 aa  655    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1689  cation transporter E1-E2 family ATPase  48.93 
 
 
753 aa  714    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  45.01 
 
 
835 aa  687    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  41.45 
 
 
819 aa  657    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  44.58 
 
 
806 aa  638    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  47.17 
 
 
759 aa  637    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  47.12 
 
 
834 aa  751    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  44.59 
 
 
955 aa  750    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0606  copper exporting ATPase  47.93 
 
 
833 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2846  copper-translocating P-type ATPase  50.61 
 
 
744 aa  715    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.515584  hitchhiker  0.000113532 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3191  copper-translocating P-type ATPase  50.93 
 
 
760 aa  744    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.427707  normal  0.767066 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  44.18 
 
 
803 aa  661    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  54.22 
 
 
742 aa  819    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1505  copper-translocating P-type ATPase  50.61 
 
 
744 aa  714    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  44.03 
 
 
961 aa  747    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  47.77 
 
 
753 aa  672    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  44.33 
 
 
826 aa  655    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
939 aa  730    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  46.89 
 
 
834 aa  748    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  45.42 
 
 
762 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  45.55 
 
 
762 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  47 
 
 
834 aa  746    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  43.65 
 
 
841 aa  689    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  44.79 
 
 
815 aa  659    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  48.08 
 
 
747 aa  673    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  42.56 
 
 
841 aa  644    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  44.52 
 
 
806 aa  638    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  44.21 
 
 
955 aa  742    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  45.55 
 
 
762 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  42.64 
 
 
836 aa  684    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  42.22 
 
 
827 aa  668    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  47.31 
 
 
743 aa  642    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  43.99 
 
 
852 aa  681    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2772  copper-translocating P-type ATPase  50.87 
 
 
757 aa  749    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  47.12 
 
 
834 aa  750    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  46.37 
 
 
797 aa  672    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  68.97 
 
 
782 aa  1097    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2255  copper-translocating P-type ATPase  49.25 
 
 
869 aa  787    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  45.56 
 
 
821 aa  672    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  43.07 
 
 
840 aa  665    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00395  Cation transport ATPase  70.11 
 
 
747 aa  1080    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  42.96 
 
 
841 aa  653    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0802  copper-transporting P-type ATPase  47.88 
 
 
902 aa  753    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  47.92 
 
 
759 aa  671    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  49.41 
 
 
850 aa  812    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1535  copper-translocating P-type ATPase  50.47 
 
 
744 aa  710    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.639562  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1485  copper-translocating P-type ATPase  50.94 
 
 
752 aa  728    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01268  cation transport ATPase  44.32 
 
 
898 aa  710    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  46.28 
 
 
750 aa  649    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  42.76 
 
 
838 aa  653    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  42.46 
 
 
836 aa  669    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  41.8 
 
 
833 aa  645    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  49.73 
 
 
752 aa  702    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  45.78 
 
 
831 aa  671    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  43.84 
 
 
818 aa  651    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  53.81 
 
 
740 aa  818    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  42.87 
 
 
829 aa  644    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  64.69 
 
 
750 aa  1010    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  48.91 
 
 
737 aa  639    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  43.52 
 
 
855 aa  670    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1408  copper-translocating P-type ATPase  50.41 
 
 
744 aa  706    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.659936  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  42.6 
 
 
889 aa  648    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  43.08 
 
 
889 aa  658    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  48.02 
 
 
758 aa  650    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2587  copper-translocating P-type ATPase  49.67 
 
 
758 aa  726    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0901243 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2654  copper-translocating P-type ATPase  49.27 
 
 
758 aa  724    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  45.55 
 
 
762 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0212  copper-translocating P-type ATPase  69.61 
 
 
746 aa  1029    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  42.28 
 
 
833 aa  668    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  49.32 
 
 
795 aa  635    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
797 aa  647    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0270  copper-translocating P-type ATPase  70.22 
 
 
748 aa  1057    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0545  copper exporting ATPase  47.82 
 
 
833 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  70.48 
 
 
778 aa  1095    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  45.42 
 
 
767 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2761  copper-translocating P-type ATPase  49.6 
 
 
753 aa  724    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  47.38 
 
 
786 aa  680    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  43.25 
 
 
836 aa  664    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  43.25 
 
 
836 aa  664    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  47.12 
 
 
834 aa  749    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  69.71 
 
 
747 aa  1041    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 
844 aa  1712    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0562  copper exporting ATPase  47.82 
 
 
833 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.304776  normal  0.828863 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  45.63 
 
 
913 aa  746    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  53.44 
 
 
860 aa  869    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  47 
 
 
834 aa  746    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0552  copper exporting ATPase  47.93 
 
 
833 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  47 
 
 
834 aa  747    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  43.53 
 
 
833 aa  692    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1807  cation transporter E1-E2 family ATPase  45.18 
 
 
915 aa  722    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  47.88 
 
 
832 aa  770    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  43.04 
 
 
827 aa  655    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>