More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3126 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00435  copper transporter  100 
 
 		 834 aa  1683    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 		 834 aa  1683    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3191  copper-translocating P-type ATPase  48.14 
 
 		 760 aa  689    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.427707  normal  0.767066 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2072  copper-translocating P-type ATPase  50.69 
 
 		 725 aa  659    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  66.11 
 
 		 961 aa  1170    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1689  cation transporter E1-E2 family ATPase  50.67 
 
 		 753 aa  714    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0270  copper-translocating P-type ATPase  50.27 
 
 		 748 aa  728    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  71.02 
 
 		 907 aa  1199    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  66.63 
 
 		 955 aa  1180    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  100 
 
 		 834 aa  1683    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  85.41 
 
 		 832 aa  1454    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0802  copper-transporting P-type ATPase  50.18 
 
 		 902 aa  829    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  67.59 
 
 		 939 aa  1172    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  99.4 
 
 		 834 aa  1672    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1499  copper-translocating P-type ATPase  52.23 
 
 		 744 aa  715    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0545  copper exporting ATPase  93.16 
 
 		 833 aa  1538    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  99.04 
 
 		 834 aa  1665    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2772  copper-translocating P-type ATPase  49.53 
 
 		 757 aa  719    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0562  copper exporting ATPase  93.16 
 
 		 833 aa  1538    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.304776  normal  0.828863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  92.92 
 
 		 833 aa  1535    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  98.44 
 
 		 834 aa  1657    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  47.74 
 
 		 740 aa  707    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00395  Cation transport ATPase  51.56 
 
 		 747 aa  739    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1505  copper-translocating P-type ATPase  52.09 
 
 		 744 aa  713    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1485  copper-translocating P-type ATPase  48.52 
 
 		 752 aa  667    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  99.16 
 
 		 834 aa  1668    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  42.2 
 
 		 837 aa  646    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1408  copper-translocating P-type ATPase  50.88 
 
 		 744 aa  701    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.659936  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0606  copper exporting ATPase  93.04 
 
 		 833 aa  1538    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01268  cation transport ATPase  50.36 
 
 		 898 aa  804    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  99.04 
 
 		 834 aa  1669    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  47.61 
 
 		 742 aa  705    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  48.86 
 
 		 850 aa  732    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  71.38 
 
 		 907 aa  1208    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  51.9 
 
 		 782 aa  764    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1535  copper-translocating P-type ATPase  51.96 
 
 		 744 aa  712    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.639562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  51.42 
 
 		 750 aa  744    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2255  copper-translocating P-type ATPase  45.13 
 
 		 869 aa  704    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004188  copper-translocating P-type ATPase  49.88 
 
 		 909 aa  805    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2587  copper-translocating P-type ATPase  50.99 
 
 		 758 aa  719    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901243 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2654  copper-translocating P-type ATPase  51.26 
 
 		 758 aa  718    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  68.38 
 
 		 913 aa  1153    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0212  copper-translocating P-type ATPase  49.32 
 
 		 746 aa  702    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  50.27 
 
 		 747 aa  726    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  99.04 
 
 		 834 aa  1669    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0552  copper exporting ATPase  93.04 
 
 		 833 aa  1539    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2846  copper-translocating P-type ATPase  52.23 
 
 		 744 aa  714    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.515584  hitchhiker  0.000113532 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  51.41 
 
 		 778 aa  752    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2761  copper-translocating P-type ATPase  51.33 
 
 		 753 aa  720    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  46.89 
 
 		 844 aa  777    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  50.12 
 
 		 860 aa  780    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  66.55 
 
 		 955 aa  1181    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1807  cation transporter E1-E2 family ATPase  51.02 
 
 		 915 aa  789    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  42.39 
 
 		 835 aa  633  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  42.54 
 
 		 827 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  43.14 
 
 		 839 aa  625  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  41.96 
 
 		 826 aa  622  1e-177  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  41.71 
 
 		 841 aa  621  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  41.38 
 
 		 852 aa  620  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  41.74 
 
 		 833 aa  618  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  41.22 
 
 		 836 aa  615  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  40.86 
 
 		 833 aa  612  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  41.25 
 
 		 855 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  41.4 
 
 		 836 aa  600  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  42.47 
 
 		 836 aa  600  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  41.93 
 
 		 824 aa  601  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  42.47 
 
 		 836 aa  600  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  41.24 
 
 		 837 aa  598  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  41.32 
 
 		 826 aa  594  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  41.62 
 
 		 839 aa  595  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  41.31 
 
 		 838 aa  595  1e-168  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  40.42 
 
 		 827 aa  593  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  41.21 
 
 		 827 aa  595  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  40.8 
 
 		 834 aa  591  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  42.72 
 
 		 762 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  42.44 
 
 		 841 aa  590  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  40.64 
 
 		 814 aa  590  1e-167  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  42.99 
 
 		 762 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  40.23 
 
 		 840 aa  586  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 767 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 762 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  42.72 
 
 		 762 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  40.12 
 
 		 819 aa  584  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  41.09 
 
 		 833 aa  584  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  43.15 
 
 		 786 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  39.67 
 
 		 826 aa  584  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  39.45 
 
 		 841 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  42.09 
 
 		 814 aa  581  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  42.95 
 
 		 831 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  37.91 
 
 		 818 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  43.46 
 
 		 753 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  46 
 
 		 810 aa  572  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  42.71 
 
 		 752 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  37.17 
 
 		 889 aa  570  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  43.76 
 
 		 837 aa  570  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  43.4 
 
 		 759 aa  567  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  38.22 
 
 		 815 aa  566  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  40.45 
 
 		 829 aa  568  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  40.6 
 
 		 837 aa  568  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  48.21 
 
 		 786 aa  567  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>