More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1807 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00435  copper transporter  51.02 
 
 		 834 aa  781    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  51.02 
 
 		 834 aa  781    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1408  copper-translocating P-type ATPase  50.13 
 
 		 744 aa  706    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.659936  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3191  copper-translocating P-type ATPase  47.28 
 
 		 760 aa  696    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.427707  normal  0.767066 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2072  copper-translocating P-type ATPase  47.6 
 
 		 725 aa  650    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  48.01 
 
 		 740 aa  713    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  48.83 
 
 		 907 aa  820    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2846  copper-translocating P-type ATPase  49.66 
 
 		 744 aa  701    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.515584  hitchhiker  0.000113532 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1689  cation transporter E1-E2 family ATPase  49.6 
 
 		 753 aa  719    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  50.06 
 
 		 832 aa  811    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0270  copper-translocating P-type ATPase  49.26 
 
 		 748 aa  743    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0802  copper-transporting P-type ATPase  52.42 
 
 		 902 aa  891    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  51.14 
 
 		 834 aa  787    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  49.22 
 
 		 907 aa  828    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  51.14 
 
 		 834 aa  785    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1485  copper-translocating P-type ATPase  48.47 
 
 		 752 aa  694    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  51.02 
 
 		 834 aa  786    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  47.41 
 
 		 939 aa  798    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2772  copper-translocating P-type ATPase  48.15 
 
 		 757 aa  696    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  50.07 
 
 		 747 aa  734    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  47.47 
 
 		 955 aa  801    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  51.02 
 
 		 834 aa  781    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  50.9 
 
 		 834 aa  782    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  48.14 
 
 		 742 aa  712    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  49.76 
 
 		 833 aa  779    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2255  copper-translocating P-type ATPase  43.96 
 
 		 869 aa  676    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1505  copper-translocating P-type ATPase  49.73 
 
 		 744 aa  698    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  48.82 
 
 		 961 aa  785    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  47.84 
 
 		 782 aa  718    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  50.9 
 
 		 834 aa  782    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00395  Cation transport ATPase  47.76 
 
 		 747 aa  696    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  44.93 
 
 		 850 aa  702    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0562  copper exporting ATPase  49.76 
 
 		 833 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.304776  normal  0.828863 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01268  cation transport ATPase  65.74 
 
 		 898 aa  1164    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  48.9 
 
 		 913 aa  808    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  47.06 
 
 		 750 aa  716    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1535  copper-translocating P-type ATPase  49.39 
 
 		 744 aa  696    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.639562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004188  copper-translocating P-type ATPase  63.01 
 
 		 909 aa  1137    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0552  copper exporting ATPase  49.76 
 
 		 833 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2587  copper-translocating P-type ATPase  49.34 
 
 		 758 aa  718    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901243 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2654  copper-translocating P-type ATPase  49.47 
 
 		 758 aa  717    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0212  copper-translocating P-type ATPase  48.98 
 
 		 746 aa  683    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0606  copper exporting ATPase  49.76 
 
 		 833 aa  781    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  46.69 
 
 		 778 aa  697    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0545  copper exporting ATPase  50.48 
 
 		 833 aa  779    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2761  copper-translocating P-type ATPase  49.67 
 
 		 753 aa  719    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  45.18 
 
 		 844 aa  742    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  51.25 
 
 		 834 aa  789    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  45.6 
 
 		 860 aa  755    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1499  copper-translocating P-type ATPase  49.93 
 
 		 744 aa  703    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1807  cation transporter E1-E2 family ATPase  100 
 
 		 915 aa  1864    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  47.57 
 
 		 955 aa  800    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  41.92 
 
 		 837 aa  620  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  41.85 
 
 		 855 aa  617  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  44.25 
 
 		 826 aa  615  9.999999999999999e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  43.17 
 
 		 827 aa  605  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 836 aa  602  1.0000000000000001e-171  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6890  copper-translocating P-type ATPase  44.47 
 
 		 754 aa  601  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  49.43 
 
 		 804 aa  596  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  42.76 
 
 		 762 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4950  copper-translocating P-type ATPase  45.76 
 
 		 748 aa  595  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  42.76 
 
 		 762 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  42.76 
 
 		 762 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  42.76 
 
 		 762 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  42.63 
 
 		 767 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6644  copper-translocating P-type ATPase  44.13 
 
 		 753 aa  592  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.935468  normal  0.257295 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  40.05 
 
 		 841 aa  592  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  49.43 
 
 		 818 aa  592  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  49.43 
 
 		 773 aa  590  1e-167  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  42.95 
 
 		 752 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  40.96 
 
 		 839 aa  586  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  48.61 
 
 		 801 aa  588  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  39.24 
 
 		 836 aa  587  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2925  heavy metal translocating P-type ATPase  45.98 
 
 		 767 aa  588  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  42.18 
 
 		 833 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  48.61 
 
 		 787 aa  583  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1480  heavy metal translocating P-type ATPase  49.76 
 
 		 811 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  39.48 
 
 		 833 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  42.72 
 
 		 814 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  38.67 
 
 		 894 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  42.62 
 
 		 831 aa  579  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  39.58 
 
 		 835 aa  582  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1072  heavy metal translocating P-type ATPase  49.27 
 
 		 755 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  39.38 
 
 		 827 aa  580  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3058  copper-translocating P-type ATPase  42.82 
 
 		 740 aa  582  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0911  heavy metal translocating P-type ATPase  49.1 
 
 		 831 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  40.87 
 
 		 826 aa  577  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  48.69 
 
 		 737 aa  578  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  43.22 
 
 		 750 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  38.14 
 
 		 828 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  48.29 
 
 		 786 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  41.58 
 
 		 753 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  41.72 
 
 		 834 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  43.96 
 
 		 747 aa  574  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  40.83 
 
 		 839 aa  573  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  39.91 
 
 		 827 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00260  putative copper transport-related membrane protein  43.05 
 
 		 741 aa  575  1.0000000000000001e-162  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348825  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  46.66 
 
 		 795 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  49.59 
 
 		 1020 aa  571  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  48.93 
 
 		 793 aa  570  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>