More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2925 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3106  copper-translocating P-type ATPase  60.99 
 
 		 742 aa  906    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  45.12 
 
 		 759 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  46.88 
 
 		 831 aa  648    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  45.12 
 
 		 759 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6890  copper-translocating P-type ATPase  69.41 
 
 		 754 aa  1030    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00260  putative copper transport-related membrane protein  61.73 
 
 		 741 aa  900    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348825  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  48.01 
 
 		 753 aa  659    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  47.18 
 
 		 743 aa  650    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6644  copper-translocating P-type ATPase  68.86 
 
 		 753 aa  1027    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.935468  normal  0.257295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  46.83 
 
 		 750 aa  653    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  46.87 
 
 		 837 aa  647    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3058  copper-translocating P-type ATPase  63.28 
 
 		 740 aa  948    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2925  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 767 aa  1560    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  45.54 
 
 		 815 aa  642    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  47.42 
 
 		 752 aa  655    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1499  cation-transporting ATPase; copper-exporting ATPase  61.39 
 
 		 804 aa  895    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.037718  normal  0.0386539 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  45.94 
 
 		 797 aa  646    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  47.16 
 
 		 814 aa  653    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  45.52 
 
 		 786 aa  652    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  47.76 
 
 		 836 aa  658    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4950  copper-translocating P-type ATPase  63.78 
 
 		 748 aa  927    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  45.53 
 
 		 838 aa  626  1e-178  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  46.9 
 
 		 747 aa  619  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  45.58 
 
 		 798 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  44.59 
 
 		 758 aa  613  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  47.19 
 
 		 821 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  44.33 
 
 		 794 aa  610  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  45.28 
 
 		 805 aa  609  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  45.98 
 
 		 759 aa  609  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  44.34 
 
 		 836 aa  608  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  45.07 
 
 		 837 aa  610  1e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  43.6 
 
 		 828 aa  606  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  44.63 
 
 		 818 aa  605  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  46.36 
 
 		 803 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  44.34 
 
 		 837 aa  603  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  44.16 
 
 		 894 aa  605  1.0000000000000001e-171  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  44.3 
 
 		 797 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  43.82 
 
 		 827 aa  599  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3653  heavy metal translocating P-type ATPase  44.22 
 
 		 805 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  43.43 
 
 		 828 aa  596  1e-169  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  45.54 
 
 		 817 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  44.39 
 
 		 885 aa  597  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  43.43 
 
 		 828 aa  597  1e-169  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  44.02 
 
 		 942 aa  597  1e-169  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  41.7 
 
 		 742 aa  596  1e-169  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  44.52 
 
 		 802 aa  594  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0243  heavy metal translocating P-type ATPase  45.79 
 
 		 833 aa  592  1e-168  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  44.52 
 
 		 802 aa  594  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  42.11 
 
 		 889 aa  595  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  44.18 
 
 		 826 aa  593  1e-168  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  45.28 
 
 		 806 aa  589  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  45.36 
 
 		 805 aa  589  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  45.09 
 
 		 833 aa  590  1e-167  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  44.5 
 
 		 849 aa  590  1e-167  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0657  copper-translocating P-type ATPase  45.56 
 
 		 724 aa  589  1e-167  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.737443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  42.11 
 
 		 889 aa  591  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  45.41 
 
 		 806 aa  585  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  45.1 
 
 		 805 aa  586  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  45.14 
 
 		 805 aa  588  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  45.23 
 
 		 805 aa  587  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  45.39 
 
 		 747 aa  588  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  45.1 
 
 		 805 aa  586  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  45.22 
 
 		 805 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0191  heavy metal translocating P-type ATPase  45.19 
 
 		 837 aa  583  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.562672  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0270  copper-translocating P-type ATPase  44.53 
 
 		 748 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1807  cation transporter E1-E2 family ATPase  45.65 
 
 		 915 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  45.28 
 
 		 806 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  44.91 
 
 		 798 aa  582  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  45.32 
 
 		 742 aa  579  1e-164  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  44.91 
 
 		 798 aa  582  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  45.05 
 
 		 740 aa  578  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  46.73 
 
 		 801 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3496  copper-translocating P-type ATPase  43.96 
 
 		 805 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  43.66 
 
 		 850 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  46.95 
 
 		 751 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  44.9 
 
 		 799 aa  578  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3584  copper-translocating P-type ATPase  43.49 
 
 		 805 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  44.34 
 
 		 839 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  43.35 
 
 		 840 aa  573  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0879  heavy metal translocating P-type ATPase  44.42 
 
 		 762 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.573666  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  43.45 
 
 		 750 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  45.39 
 
 		 1087 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  44.69 
 
 		 1071 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  43.3 
 
 		 836 aa  569  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  42.02 
 
 		 857 aa  570  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  43.3 
 
 		 836 aa  569  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  44.03 
 
 		 826 aa  571  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0212  copper-translocating P-type ATPase  44.76 
 
 		 746 aa  571  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  43.25 
 
 		 954 aa  568  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  39.66 
 
 		 839 aa  565  1e-160  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  42.14 
 
 		 758 aa  568  1e-160  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01268  cation transport ATPase  42.47 
 
 		 898 aa  567  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1581  heavy metal translocating P-type ATPase  45.19 
 
 		 755 aa  567  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  43.03 
 
 		 762 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  46.61 
 
 		 736 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 737 aa  562  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  42.93 
 
 		 782 aa  562  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  40.75 
 
 		 796 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004188  copper-translocating P-type ATPase  42.93 
 
 		 909 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1259  heavy metal translocating P-type ATPase  43.02 
 
 		 834 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499676  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>