More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2080 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  59.27 
 
 		 852 aa  897    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  42.3 
 
 		 818 aa  637    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  58.24 
 
 		 759 aa  823    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  56.83 
 
 		 832 aa  779    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  57.11 
 
 		 826 aa  872    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  55.58 
 
 		 827 aa  843    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  53.36 
 
 		 837 aa  791    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  61.43 
 
 		 829 aa  889    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  60.07 
 
 		 840 aa  924    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  47.42 
 
 		 811 aa  676    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  59.39 
 
 		 839 aa  895    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2890  copper-translocating P-type ATPase  58.02 
 
 		 813 aa  818    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  54.03 
 
 		 834 aa  827    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  47.42 
 
 		 811 aa  676    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  54.65 
 
 		 829 aa  773    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  58.5 
 
 		 833 aa  885    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2086  heavy metal translocating P-type ATPase  63.88 
 
 		 744 aa  838    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  45.65 
 
 		 759 aa  635    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1259  heavy metal translocating P-type ATPase  63.35 
 
 		 834 aa  977    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  60.64 
 
 		 762 aa  858    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  59.04 
 
 		 833 aa  898    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  45.65 
 
 		 759 aa  635    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1661  heavy metal translocating P-type ATPase  55.1 
 
 		 825 aa  760    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119959  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  57 
 
 		 827 aa  874    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  56.13 
 
 		 841 aa  850    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  54.73 
 
 		 856 aa  753    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2679  heavy metal translocating P-type ATPase  52.33 
 
 		 857 aa  771    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  52.59 
 
 		 838 aa  745    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  46.99 
 
 		 836 aa  666    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  62.61 
 
 		 836 aa  988    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  52.2 
 
 		 838 aa  777    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  52.02 
 
 		 836 aa  795    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  53.06 
 
 		 833 aa  757    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 814 aa  1601    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  43.37 
 
 		 798 aa  655    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  46.03 
 
 		 835 aa  666    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2185  heavy metal translocating P-type ATPase  50.47 
 
 		 754 aa  665    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  60.64 
 
 		 762 aa  859    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  59.53 
 
 		 855 aa  912    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  39.31 
 
 		 889 aa  637    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 889 aa  638    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  60.27 
 
 		 835 aa  904    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 821 aa  723    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2813  heavy metal translocating P-type ATPase  57.2 
 
 		 830 aa  786    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  60.51 
 
 		 767 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  57.95 
 
 		 841 aa  847    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  54.06 
 
 		 824 aa  755    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  56.31 
 
 		 827 aa  843    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1536  heavy metal translocating P-type ATPase  57.64 
 
 		 813 aa  825    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.627747 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  45.68 
 
 		 814 aa  641    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  54.52 
 
 		 819 aa  820    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  60.51 
 
 		 762 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  55.19 
 
 		 807 aa  792    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  60.64 
 
 		 762 aa  859    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  56.7 
 
 		 832 aa  759    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  55.04 
 
 		 826 aa  845    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  62.61 
 
 		 836 aa  988    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  53.14 
 
 		 826 aa  776    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1129  heavy metal translocating P-type ATPase  56.61 
 
 		 840 aa  814    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.979362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  58.61 
 
 		 841 aa  896    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  42.75 
 
 		 797 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  41.03 
 
 		 815 aa  633  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  50.06 
 
 		 824 aa  630  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  45.71 
 
 		 831 aa  627  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  44.7 
 
 		 821 aa  627  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  41.22 
 
 		 844 aa  625  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  41.38 
 
 		 817 aa  623  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  42.53 
 
 		 885 aa  619  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  44.05 
 
 		 753 aa  620  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  42.89 
 
 		 839 aa  622  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  47.43 
 
 		 737 aa  619  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3504  heavy metal translocating P-type ATPase  51.03 
 
 		 743 aa  620  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  51.05 
 
 		 788 aa  621  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  40.78 
 
 		 805 aa  617  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  49.92 
 
 		 736 aa  618  1e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  44.5 
 
 		 752 aa  617  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  41.31 
 
 		 797 aa  616  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  46.06 
 
 		 837 aa  616  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  43.76 
 
 		 803 aa  618  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  41.64 
 
 		 857 aa  614  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  44.43 
 
 		 782 aa  613  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  44.6 
 
 		 778 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  39.85 
 
 		 894 aa  610  1e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  41.11 
 
 		 794 aa  608  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  41.3 
 
 		 798 aa  612  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  44.56 
 
 		 747 aa  609  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  50.98 
 
 		 793 aa  610  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  41.3 
 
 		 798 aa  612  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  43.16 
 
 		 750 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  44.74 
 
 		 786 aa  609  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  42.51 
 
 		 828 aa  612  1e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  47.38 
 
 		 735 aa  608  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  41.96 
 
 		 954 aa  608  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  48.58 
 
 		 724 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  47.83 
 
 		 787 aa  608  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  49.1 
 
 		 810 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  41.75 
 
 		 806 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  42.89 
 
 		 824 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  41.25 
 
 		 805 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  48.8 
 
 		 755 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>