More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3223 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  49.14 
 
 
837 aa  721    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  44.47 
 
 
828 aa  694    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  48.6 
 
 
750 aa  697    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  49.88 
 
 
824 aa  647    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  43.84 
 
 
794 aa  664    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  47.16 
 
 
839 aa  651    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  49.14 
 
 
839 aa  705    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  47.6 
 
 
805 aa  726    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  47.79 
 
 
815 aa  730    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  45.94 
 
 
826 aa  660    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  44.34 
 
 
828 aa  692    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  46.37 
 
 
798 aa  668    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  47.6 
 
 
805 aa  706    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  47.72 
 
 
805 aa  708    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  47.6 
 
 
805 aa  706    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  46.31 
 
 
833 aa  654    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  50.32 
 
 
831 aa  682    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  46.06 
 
 
797 aa  696    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  48.16 
 
 
840 aa  681    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  48.27 
 
 
803 aa  698    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2679  heavy metal translocating P-type ATPase  44.51 
 
 
857 aa  640    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  47.65 
 
 
954 aa  700    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  47.6 
 
 
790 aa  644    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  50.67 
 
 
821 aa  713    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  50.53 
 
 
753 aa  727    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2925  heavy metal translocating P-type ATPase  47.09 
 
 
767 aa  635    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  42.48 
 
 
826 aa  640    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  46.57 
 
 
836 aa  658    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  48.01 
 
 
849 aa  654    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  47.17 
 
 
834 aa  678    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  46.89 
 
 
827 aa  665    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  47.72 
 
 
805 aa  707    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3584  copper-translocating P-type ATPase  48.18 
 
 
805 aa  655    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  42.87 
 
 
836 aa  652    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  47.6 
 
 
805 aa  706    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  49.6 
 
 
759 aa  724    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  49.33 
 
 
747 aa  660    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3653  heavy metal translocating P-type ATPase  47.93 
 
 
805 aa  673    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  48.25 
 
 
857 aa  726    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3496  copper-translocating P-type ATPase  49.11 
 
 
805 aa  645    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  49.6 
 
 
759 aa  724    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  48.35 
 
 
852 aa  691    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  44.59 
 
 
828 aa  695    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  47.6 
 
 
806 aa  706    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  46.36 
 
 
816 aa  640    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  46.37 
 
 
798 aa  668    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  47.35 
 
 
806 aa  704    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  48.05 
 
 
827 aa  686    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  47.72 
 
 
805 aa  708    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  47.82 
 
 
942 aa  697    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  46.63 
 
 
841 aa  666    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  47.75 
 
 
827 aa  689    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  45.84 
 
 
819 aa  660    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  47.72 
 
 
838 aa  644    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  50.46 
 
 
837 aa  680    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  45.9 
 
 
818 aa  698    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  46.57 
 
 
836 aa  658    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  49.57 
 
 
838 aa  727    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  47.93 
 
 
836 aa  713    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  48.96 
 
 
833 aa  699    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  45.68 
 
 
814 aa  641    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6890  copper-translocating P-type ATPase  46.93 
 
 
754 aa  660    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  48.35 
 
 
743 aa  682    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  48 
 
 
837 aa  694    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  46.69 
 
 
817 aa  639    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  56.07 
 
 
751 aa  693    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  52.64 
 
 
836 aa  786    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6644  copper-translocating P-type ATPase  45.54 
 
 
753 aa  644    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.935468  normal  0.257295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  47.98 
 
 
855 aa  676    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  47.63 
 
 
817 aa  717    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  44.73 
 
 
889 aa  697    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  44.85 
 
 
889 aa  692    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  48.29 
 
 
758 aa  675    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  45.95 
 
 
799 aa  665    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  47.79 
 
 
833 aa  676    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  47.98 
 
 
798 aa  712    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  48.6 
 
 
835 aa  692    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  47.06 
 
 
826 aa  669    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  47.47 
 
 
806 aa  702    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  48.9 
 
 
826 aa  695    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
814 aa  1630    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  48.03 
 
 
829 aa  647    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  51.66 
 
 
752 aa  732    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  46.28 
 
 
758 aa  661    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  50.64 
 
 
786 aa  697    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  48.34 
 
 
797 aa  723    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  48.82 
 
 
759 aa  683    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  45.28 
 
 
796 aa  692    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  45.01 
 
 
885 aa  649    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  47.91 
 
 
841 aa  679    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  45.48 
 
 
820 aa  635    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  44.59 
 
 
894 aa  683    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  42.91 
 
 
802 aa  633  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  42.91 
 
 
802 aa  633  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1259  heavy metal translocating P-type ATPase  46.75 
 
 
834 aa  634  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499676  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  47.49 
 
 
767 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  47.76 
 
 
762 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  47.37 
 
 
804 aa  630  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  47.63 
 
 
762 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3058  copper-translocating P-type ATPase  44.18 
 
 
740 aa  631  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>