More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1848 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  46.45 
 
 		 828 aa  663    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  48.94 
 
 		 759 aa  710    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  46.37 
 
 		 799 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  53.31 
 
 		 802 aa  776    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  54.38 
 
 		 794 aa  781    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  48.31 
 
 		 748 aa  646    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3348  cation-transporting ATPase transmembrane protein  46.58 
 
 		 748 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  58.25 
 
 		 805 aa  835    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  47.52 
 
 		 817 aa  684    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  47.9 
 
 		 885 aa  714    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  46.62 
 
 		 826 aa  646    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  46.41 
 
 		 732 aa  643    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  58.41 
 
 		 798 aa  798    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  58.1 
 
 		 805 aa  810    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  58.23 
 
 		 805 aa  811    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  58.23 
 
 		 805 aa  812    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  46.63 
 
 		 1061 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  47.45 
 
 		 813 aa  660    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  58.77 
 
 		 806 aa  816    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  46.82 
 
 		 732 aa  652    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  46.53 
 
 		 740 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  59.09 
 
 		 803 aa  862    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  47.19 
 
 		 827 aa  644    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  52.04 
 
 		 814 aa  638    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3584  copper-translocating P-type ATPase  47.87 
 
 		 805 aa  671    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  50.79 
 
 		 954 aa  707    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  47.71 
 
 		 790 aa  679    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  51.73 
 
 		 753 aa  785    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  46.63 
 
 		 1061 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  49.14 
 
 		 866 aa  704    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 		 743 aa  1491    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  46.96 
 
 		 797 aa  667    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  46.41 
 
 		 759 aa  639    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  49.87 
 
 		 834 aa  688    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  56.12 
 
 		 796 aa  789    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  46.54 
 
 		 1040 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  46.09 
 
 		 799 aa  637    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  46.25 
 
 		 852 aa  641    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  52.04 
 
 		 817 aa  660    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  58.1 
 
 		 805 aa  810    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  46.63 
 
 		 1061 aa  641    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  48.52 
 
 		 747 aa  711    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  50.8 
 
 		 801 aa  657    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  50.6 
 
 		 837 aa  718    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  49.47 
 
 		 857 aa  711    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  47.33 
 
 		 971 aa  638    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3496  copper-translocating P-type ATPase  47.35 
 
 		 805 aa  653    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  51.79 
 
 		 804 aa  639    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  46.63 
 
 		 1063 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  47.34 
 
 		 937 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  46.66 
 
 		 762 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  49.53 
 
 		 792 aa  681    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0938  heavy metal translocating P-type ATPase  47.5 
 
 		 730 aa  644    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.485974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  47.5 
 
 		 730 aa  644    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  49.22 
 
 		 831 aa  691    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  46.2 
 
 		 795 aa  652    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  64.14 
 
 		 797 aa  949    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  50.2 
 
 		 942 aa  696    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  47.67 
 
 		 838 aa  655    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  46.12 
 
 		 833 aa  648    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  47.57 
 
 		 1182 aa  650    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  46.32 
 
 		 762 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  50.33 
 
 		 838 aa  707    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  49.8 
 
 		 836 aa  711    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  48.28 
 
 		 833 aa  677    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  46.66 
 
 		 767 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  45.89 
 
 		 839 aa  644    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  47.07 
 
 		 1021 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  46.37 
 
 		 799 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  48.19 
 
 		 827 aa  671    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  50.27 
 
 		 751 aa  683    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  46.1 
 
 		 800 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  50.81 
 
 		 836 aa  750    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  46.87 
 
 		 855 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  46.62 
 
 		 1013 aa  638    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  51.6 
 
 		 889 aa  744    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  51.99 
 
 		 889 aa  749    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  51.66 
 
 		 758 aa  729    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  46.66 
 
 		 762 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  52.97 
 
 		 792 aa  635    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  58.37 
 
 		 805 aa  816    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  60.73 
 
 		 799 aa  885    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  48 
 
 		 946 aa  651    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  49.32 
 
 		 792 aa  678    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  46.63 
 
 		 742 aa  650    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  47.07 
 
 		 1021 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  62.77 
 
 		 821 aa  879    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  48.35 
 
 		 814 aa  682    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  47.78 
 
 		 782 aa  642    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  46.63 
 
 		 1061 aa  643    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  51.37 
 
 		 786 aa  731    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  46.51 
 
 		 828 aa  667    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  46.63 
 
 		 1063 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  46.7 
 
 		 872 aa  655    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  58.25 
 
 		 806 aa  809    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  48.7 
 
 		 804 aa  694    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  47.66 
 
 		 836 aa  685    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  46.52 
 
 		 762 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  48.04 
 
 		 840 aa  683    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  47.31 
 
 		 844 aa  642    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>