More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5373 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
937 aa  1817    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0031  heavy metal translocating P-type ATPase  57.38 
 
 
747 aa  678    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  60.39 
 
 
740 aa  805    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  58.52 
 
 
799 aa  842    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  72.18 
 
 
1061 aa  1203    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  71.97 
 
 
1061 aa  1201    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3348  cation-transporting ATPase transmembrane protein  60.96 
 
 
748 aa  779    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1916  copper-translocating P-type ATPase  47.53 
 
 
791 aa  701    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  59.04 
 
 
732 aa  785    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  71.97 
 
 
1061 aa  1200    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  58.77 
 
 
732 aa  788    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3376  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  59.9 
 
 
819 aa  822    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  59.78 
 
 
790 aa  848    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  72.07 
 
 
1061 aa  1201    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  49.29 
 
 
823 aa  685    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  47.22 
 
 
743 aa  660    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  57.58 
 
 
797 aa  848    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  44.71 
 
 
797 aa  683    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  84.23 
 
 
1040 aa  1451    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  46.26 
 
 
803 aa  652    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  58.62 
 
 
792 aa  844    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0037  heavy metal translocating P-type ATPase  55.57 
 
 
782 aa  751    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374671  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  71.01 
 
 
971 aa  1193    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  71.97 
 
 
1063 aa  1201    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0024  heavy metal translocating P-type ATPase  55.83 
 
 
757 aa  713    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  50.13 
 
 
724 aa  676    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0938  heavy metal translocating P-type ATPase  55.88 
 
 
730 aa  705    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.485974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  55.88 
 
 
730 aa  705    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  59.54 
 
 
816 aa  827    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  69.89 
 
 
795 aa  980    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  49.52 
 
 
793 aa  744    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  43.34 
 
 
815 aa  672    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  61.34 
 
 
741 aa  805    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  57.94 
 
 
790 aa  835    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0019  heavy metal translocating P-type ATPase  55.69 
 
 
782 aa  752    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2466  heavy metal translocating P-type ATPase  58.96 
 
 
745 aa  688    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392778  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  70.3 
 
 
872 aa  1091    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3524  heavy metal translocating P-type ATPase  58.34 
 
 
813 aa  788    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  47.66 
 
 
849 aa  640    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  45.66 
 
 
836 aa  635    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  84.85 
 
 
1021 aa  1470    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  60.12 
 
 
817 aa  879    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1407  heavy metal translocating P-type ATPase  49.94 
 
 
758 aa  677    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.688507  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1058  heavy metal translocating P-type ATPase  55.74 
 
 
754 aa  664    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  68.65 
 
 
835 aa  1054    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  59.53 
 
 
813 aa  888    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  95.47 
 
 
946 aa  1665    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  58.55 
 
 
792 aa  842    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  58.3 
 
 
799 aa  839    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  60.24 
 
 
739 aa  743    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  84.85 
 
 
1021 aa  1470    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  84.57 
 
 
1013 aa  1430    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  58.52 
 
 
800 aa  842    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  48.8 
 
 
789 aa  719    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  72.07 
 
 
1063 aa  1201    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  61.33 
 
 
804 aa  879    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  57.86 
 
 
767 aa  708    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  57.26 
 
 
799 aa  823    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  80.43 
 
 
1182 aa  1373    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  42.18 
 
 
817 aa  630  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  43.23 
 
 
805 aa  632  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  43.59 
 
 
798 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  44.36 
 
 
797 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  42.67 
 
 
794 aa  626  1e-178  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  42.82 
 
 
802 aa  624  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  42.82 
 
 
802 aa  624  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  45.11 
 
 
885 aa  618  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  46.6 
 
 
838 aa  617  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  44.84 
 
 
799 aa  617  1e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  45.98 
 
 
835 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  46.56 
 
 
794 aa  610  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  46.56 
 
 
827 aa  609  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  45.32 
 
 
837 aa  609  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  43.32 
 
 
806 aa  609  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  46.71 
 
 
833 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  43.15 
 
 
806 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  46.49 
 
 
852 aa  608  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  42.99 
 
 
805 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  44.85 
 
 
835 aa  605  1.0000000000000001e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  42.99 
 
 
805 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  44.65 
 
 
837 aa  603  1.0000000000000001e-171  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  42.96 
 
 
806 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  42.75 
 
 
805 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  42.63 
 
 
805 aa  600  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  42.87 
 
 
805 aa  602  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  44.71 
 
 
821 aa  602  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  46.77 
 
 
793 aa  601  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  42.75 
 
 
805 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  45.9 
 
 
841 aa  600  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1340  copper-translocating P-type ATPase  40.65 
 
 
796 aa  601  1e-170  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  46.04 
 
 
827 aa  597  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  46.07 
 
 
833 aa  597  1e-169  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  40.67 
 
 
796 aa  594  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  46.32 
 
 
839 aa  595  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  45.63 
 
 
819 aa  594  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  44.79 
 
 
826 aa  591  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1894  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
754 aa  591  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  46.27 
 
 
833 aa  591  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  44.79 
 
 
826 aa  591  1e-167  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3238  heavy metal translocating P-type ATPase  47.17 
 
 
831 aa  590  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141164  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>