More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3543 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  58.95 
 
 
1061 aa  770    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  61.56 
 
 
799 aa  777    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  61.64 
 
 
799 aa  795    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3348  cation-transporting ATPase transmembrane protein  85.5 
 
 
748 aa  1176    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1916  copper-translocating P-type ATPase  50.48 
 
 
791 aa  689    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  53.27 
 
 
789 aa  728    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  59.13 
 
 
732 aa  784    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  58.95 
 
 
1061 aa  770    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1058  heavy metal translocating P-type ATPase  58.51 
 
 
754 aa  738    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  45.29 
 
 
797 aa  635    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  60.33 
 
 
732 aa  793    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  61.87 
 
 
800 aa  795    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  60.54 
 
 
739 aa  737    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  95.14 
 
 
741 aa  1353    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3376  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  67.26 
 
 
819 aa  854    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  61.48 
 
 
790 aa  790    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  58.95 
 
 
1061 aa  768    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  52.86 
 
 
823 aa  644    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  59.09 
 
 
797 aa  783    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0019  heavy metal translocating P-type ATPase  58.55 
 
 
782 aa  807    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  59.84 
 
 
817 aa  812    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  62.27 
 
 
1040 aa  809    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  59.64 
 
 
872 aa  783    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  59.39 
 
 
790 aa  770    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1894  heavy metal translocating P-type ATPase  54.26 
 
 
754 aa  650    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  60.45 
 
 
971 aa  758    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0024  heavy metal translocating P-type ATPase  58.48 
 
 
757 aa  770    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  58.95 
 
 
1063 aa  770    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  50.82 
 
 
724 aa  701    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0938  heavy metal translocating P-type ATPase  58.08 
 
 
730 aa  759    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.485974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  58.08 
 
 
730 aa  759    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  60.3 
 
 
816 aa  763    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  59.07 
 
 
795 aa  793    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  51.92 
 
 
793 aa  716    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  61.7 
 
 
799 aa  778    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1407  heavy metal translocating P-type ATPase  50.87 
 
 
758 aa  675    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.688507  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  62.35 
 
 
813 aa  812    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  61.96 
 
 
1182 aa  800    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3524  heavy metal translocating P-type ATPase  65.71 
 
 
813 aa  820    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  63.5 
 
 
767 aa  798    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  59.68 
 
 
937 aa  779    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2466  heavy metal translocating P-type ATPase  60.36 
 
 
745 aa  720    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392778  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  58.95 
 
 
1063 aa  770    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  61.82 
 
 
1021 aa  813    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  61.67 
 
 
835 aa  823    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  61.87 
 
 
804 aa  788    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  46.53 
 
 
743 aa  654    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0031  heavy metal translocating P-type ATPase  59.65 
 
 
747 aa  743    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  60.61 
 
 
946 aa  795    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  61.29 
 
 
792 aa  796    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  61.55 
 
 
1013 aa  801    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  61.82 
 
 
1021 aa  813    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0037  heavy metal translocating P-type ATPase  58.83 
 
 
782 aa  808    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  61.16 
 
 
792 aa  795    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
740 aa  1448    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  58.95 
 
 
1061 aa  771    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  45.32 
 
 
815 aa  632  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  47.76 
 
 
803 aa  621  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  46.66 
 
 
797 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  45.63 
 
 
798 aa  612  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  43.4 
 
 
794 aa  595  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  49.12 
 
 
794 aa  594  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  44.28 
 
 
805 aa  589  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  44.79 
 
 
817 aa  591  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  45.61 
 
 
752 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  42.95 
 
 
802 aa  578  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  45.87 
 
 
753 aa  580  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  42.95 
 
 
802 aa  578  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1340  copper-translocating P-type ATPase  44.05 
 
 
796 aa  579  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  46.71 
 
 
835 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  46.83 
 
 
821 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  45.7 
 
 
836 aa  577  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  43.08 
 
 
759 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  44.69 
 
 
806 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  46.64 
 
 
814 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  43.08 
 
 
759 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  43.66 
 
 
798 aa  569  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  44.28 
 
 
805 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  44.69 
 
 
806 aa  572  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  43.66 
 
 
798 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  45.08 
 
 
750 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  44.28 
 
 
805 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  44.41 
 
 
805 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3238  heavy metal translocating P-type ATPase  49.2 
 
 
831 aa  569  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141164  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  46.43 
 
 
826 aa  570  1e-161  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  46.36 
 
 
837 aa  570  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  44.82 
 
 
806 aa  570  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  48.91 
 
 
793 aa  566  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  44.28 
 
 
805 aa  567  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  44.28 
 
 
805 aa  568  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  45.02 
 
 
885 aa  566  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  45.28 
 
 
841 aa  565  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  44.28 
 
 
805 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  45.85 
 
 
799 aa  568  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  43.01 
 
 
796 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  45.2 
 
 
833 aa  561  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  41.88 
 
 
818 aa  561  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  45.05 
 
 
852 aa  559  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  46.68 
 
 
849 aa  558  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  48.78 
 
 
801 aa  556  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>