More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0024 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1058  heavy metal translocating P-type ATPase  67.44 
 
 		 754 aa  875    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  55.21 
 
 		 835 aa  740    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  56.65 
 
 		 799 aa  742    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  58.45 
 
 		 792 aa  756    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  55.48 
 
 		 1063 aa  710    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3348  cation-transporting ATPase transmembrane protein  57.93 
 
 		 748 aa  749    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  70.21 
 
 		 767 aa  925    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  59.23 
 
 		 732 aa  774    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  55.05 
 
 		 1061 aa  711    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0019  heavy metal translocating P-type ATPase  70.4 
 
 		 782 aa  1004    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  57.24 
 
 		 790 aa  745    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  58.96 
 
 		 732 aa  770    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  57.6 
 
 		 813 aa  733    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3376  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  58.78 
 
 		 819 aa  738    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  60.94 
 
 		 790 aa  788    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  55.67 
 
 		 1061 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2466  heavy metal translocating P-type ATPase  54.37 
 
 		 745 aa  640    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392778  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  58.91 
 
 		 797 aa  763    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  58.37 
 
 		 804 aa  750    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  55.05 
 
 		 1061 aa  711    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  55.88 
 
 		 1040 aa  723    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  56.65 
 
 		 799 aa  741    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  56.35 
 
 		 971 aa  700    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0024  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 757 aa  1491    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0031  heavy metal translocating P-type ATPase  67.95 
 
 		 747 aa  836    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0938  heavy metal translocating P-type ATPase  54.29 
 
 		 730 aa  688    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.485974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  54.29 
 
 		 730 aa  688    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  57.46 
 
 		 816 aa  729    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  54.1 
 
 		 795 aa  709    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  49.27 
 
 		 793 aa  669    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  57.83 
 
 		 799 aa  751    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  58.48 
 
 		 740 aa  782    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  59 
 
 		 739 aa  733    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3524  heavy metal translocating P-type ATPase  59.2 
 
 		 813 aa  735    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  53.69 
 
 		 872 aa  717    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1407  heavy metal translocating P-type ATPase  50.13 
 
 		 758 aa  662    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.688507  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  55.89 
 
 		 1021 aa  726    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  55.35 
 
 		 1061 aa  708    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  57.76 
 
 		 1182 aa  731    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  56.06 
 
 		 937 aa  712    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  54.98 
 
 		 1013 aa  707    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  56.56 
 
 		 946 aa  719    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  58.31 
 
 		 792 aa  755    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  56.39 
 
 		 817 aa  731    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  55.89 
 
 		 1021 aa  726    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0037  heavy metal translocating P-type ATPase  70.36 
 
 		 782 aa  1008    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374671  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  55.05 
 
 		 1063 aa  711    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  56.32 
 
 		 800 aa  749    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  58.01 
 
 		 741 aa  780    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  49.93 
 
 		 789 aa  634  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1916  copper-translocating P-type ATPase  48.87 
 
 		 791 aa  628  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  44.64 
 
 		 743 aa  620  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  47.66 
 
 		 724 aa  620  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  51.13 
 
 		 823 aa  610  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1894  heavy metal translocating P-type ATPase  52.27 
 
 		 754 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  46.06 
 
 		 803 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 815 aa  599  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  43.29 
 
 		 794 aa  595  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  44.78 
 
 		 817 aa  595  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  41.62 
 
 		 797 aa  591  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  43.5 
 
 		 802 aa  592  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  43.5 
 
 		 802 aa  592  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  45.78 
 
 		 821 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  45.54 
 
 		 799 aa  580  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  42.82 
 
 		 805 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  45.23 
 
 		 837 aa  578  1.0000000000000001e-163  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  48.29 
 
 		 793 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  45.83 
 
 		 814 aa  572  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  43.39 
 
 		 806 aa  560  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  43.25 
 
 		 806 aa  562  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  42.76 
 
 		 753 aa  561  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  47.95 
 
 		 801 aa  559  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  43.46 
 
 		 836 aa  556  1e-157  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  45.55 
 
 		 849 aa  556  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  42.48 
 
 		 750 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  42.95 
 
 		 806 aa  553  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  42.56 
 
 		 805 aa  550  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  45.01 
 
 		 794 aa  550  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  42.16 
 
 		 797 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  45.05 
 
 		 827 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  42.56 
 
 		 805 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  41.78 
 
 		 752 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  41.64 
 
 		 818 aa  552  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  42.42 
 
 		 805 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  42.42 
 
 		 805 aa  547  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  42.42 
 
 		 805 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 796 aa  546  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  42.46 
 
 		 805 aa  547  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  44.1 
 
 		 837 aa  546  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  44.2 
 
 		 826 aa  548  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  44.5 
 
 		 838 aa  542  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  40.1 
 
 		 759 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  40.1 
 
 		 759 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  42.17 
 
 		 885 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  44.73 
 
 		 836 aa  542  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  41.88 
 
 		 798 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  41.91 
 
 		 828 aa  536  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  44.88 
 
 		 833 aa  538  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1340  copper-translocating P-type ATPase  41.98 
 
 		 796 aa  534  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3238  heavy metal translocating P-type ATPase  45.49 
 
 		 831 aa  530  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141164  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>