More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1916 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  51.25 
 
 
741 aa  699    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  50.82 
 
 
799 aa  715    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  51.13 
 
 
790 aa  723    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3348  cation-transporting ATPase transmembrane protein  49.79 
 
 
748 aa  676    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1916  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 
791 aa  1602    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0037  heavy metal translocating P-type ATPase  48.13 
 
 
782 aa  643    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374671  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  51.66 
 
 
732 aa  660    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  46.87 
 
 
1061 aa  682    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  51.52 
 
 
732 aa  677    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  46.99 
 
 
1063 aa  685    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  46.89 
 
 
1063 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3376  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  51.07 
 
 
819 aa  722    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  47.83 
 
 
1182 aa  699    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  50.5 
 
 
790 aa  736    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  46.89 
 
 
1061 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  52.46 
 
 
797 aa  743    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  46.87 
 
 
1061 aa  684    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  47.41 
 
 
1040 aa  695    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  51.84 
 
 
804 aa  745    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  52.34 
 
 
739 aa  669    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  50.06 
 
 
792 aa  738    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  44.78 
 
 
971 aa  671    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0024  heavy metal translocating P-type ATPase  48.87 
 
 
757 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  48.75 
 
 
724 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0938  heavy metal translocating P-type ATPase  52.81 
 
 
730 aa  679    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.485974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  52.81 
 
 
730 aa  679    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  51.63 
 
 
816 aa  723    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  49.08 
 
 
795 aa  658    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  65.15 
 
 
793 aa  1043    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  50.83 
 
 
740 aa  701    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  46.99 
 
 
1061 aa  684    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  47.36 
 
 
1013 aa  685    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3524  heavy metal translocating P-type ATPase  51.58 
 
 
813 aa  719    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  47.96 
 
 
1021 aa  706    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  47.23 
 
 
937 aa  694    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  48 
 
 
872 aa  704    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  50.69 
 
 
799 aa  716    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0019  heavy metal translocating P-type ATPase  47.93 
 
 
782 aa  640    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  48.06 
 
 
946 aa  704    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  50.74 
 
 
792 aa  748    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  47.96 
 
 
1021 aa  706    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  50.75 
 
 
799 aa  713    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  51.51 
 
 
813 aa  749    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  63.76 
 
 
789 aa  1006    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  50.31 
 
 
817 aa  741    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  51.07 
 
 
800 aa  717    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  49.45 
 
 
835 aa  707    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  48.56 
 
 
767 aa  630  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1407  heavy metal translocating P-type ATPase  48.45 
 
 
758 aa  626  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.688507  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0031  heavy metal translocating P-type ATPase  47.83 
 
 
747 aa  606  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  46.83 
 
 
823 aa  600  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  42.5 
 
 
798 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  44.2 
 
 
794 aa  594  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  40.15 
 
 
805 aa  587  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  40.46 
 
 
815 aa  587  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  43.43 
 
 
793 aa  587  1e-166  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
797 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  41.74 
 
 
797 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  42.11 
 
 
803 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  40.92 
 
 
836 aa  575  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  41.59 
 
 
837 aa  578  1.0000000000000001e-163  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  41.74 
 
 
837 aa  578  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  42.92 
 
 
743 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1894  heavy metal translocating P-type ATPase  43.84 
 
 
754 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  40.63 
 
 
828 aa  570  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  41.8 
 
 
798 aa  570  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  43.36 
 
 
801 aa  570  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  41.8 
 
 
798 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  42.22 
 
 
799 aa  570  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  40.44 
 
 
794 aa  566  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  40.02 
 
 
805 aa  568  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  41.61 
 
 
826 aa  565  1e-160  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  39.9 
 
 
806 aa  567  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  40.02 
 
 
805 aa  568  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  40.07 
 
 
821 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  40.92 
 
 
796 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  39.78 
 
 
805 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  39.9 
 
 
805 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  41.57 
 
 
827 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  39.78 
 
 
805 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  40.42 
 
 
806 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  39.5 
 
 
802 aa  564  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2466  heavy metal translocating P-type ATPase  47.46 
 
 
745 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392778  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  39.5 
 
 
802 aa  564  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  39.68 
 
 
805 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 
806 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1340  copper-translocating P-type ATPase  41.58 
 
 
796 aa  561  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
838 aa  555  1e-157  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  39.45 
 
 
817 aa  558  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3238  heavy metal translocating P-type ATPase  41.9 
 
 
831 aa  556  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141164  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1058  heavy metal translocating P-type ATPase  46.83 
 
 
754 aa  554  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  41.4 
 
 
835 aa  555  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  40.47 
 
 
855 aa  554  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  40.9 
 
 
840 aa  555  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  40.76 
 
 
841 aa  549  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  41.85 
 
 
811 aa  548  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  40.23 
 
 
849 aa  545  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  39.83 
 
 
833 aa  546  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  41.85 
 
 
811 aa  548  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  41.06 
 
 
833 aa  546  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>