More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1407 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  49.31 
 
 
1061 aa  681    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  52.53 
 
 
799 aa  673    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  50.87 
 
 
740 aa  675    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  51.53 
 
 
732 aa  671    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  49.43 
 
 
1061 aa  682    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  49.43 
 
 
1063 aa  683    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1407  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
758 aa  1529    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.688507  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  51.66 
 
 
732 aa  684    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  51.17 
 
 
739 aa  635    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  54.12 
 
 
813 aa  700    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3376  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  53.44 
 
 
819 aa  675    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  52.04 
 
 
790 aa  690    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  49.56 
 
 
1061 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  50.72 
 
 
797 aa  678    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  50.86 
 
 
790 aa  647    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  49.87 
 
 
792 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  50.32 
 
 
1040 aa  677    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  51.33 
 
 
741 aa  671    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  51.03 
 
 
971 aa  682    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0019  heavy metal translocating P-type ATPase  49.13 
 
 
782 aa  664    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0024  heavy metal translocating P-type ATPase  50.13 
 
 
757 aa  651    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  51.74 
 
 
1182 aa  684    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0938  heavy metal translocating P-type ATPase  50.59 
 
 
730 aa  651    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.485974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  50.59 
 
 
730 aa  651    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  52.72 
 
 
816 aa  674    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  51.21 
 
 
795 aa  699    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  47.4 
 
 
793 aa  636    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  50.75 
 
 
872 aa  702    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  50.59 
 
 
1013 aa  656    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  51.97 
 
 
804 aa  694    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  51.11 
 
 
767 aa  649    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3524  heavy metal translocating P-type ATPase  53.07 
 
 
813 aa  653    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0037  heavy metal translocating P-type ATPase  49 
 
 
782 aa  664    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374671  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0031  heavy metal translocating P-type ATPase  51.11 
 
 
747 aa  637    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  49.43 
 
 
1061 aa  683    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  50.72 
 
 
1021 aa  672    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  52.99 
 
 
799 aa  673    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  49.74 
 
 
937 aa  658    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  50.39 
 
 
946 aa  670    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  50 
 
 
792 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  51.98 
 
 
799 aa  682    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  49.43 
 
 
1063 aa  683    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  50.72 
 
 
1021 aa  672    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  52.14 
 
 
817 aa  694    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  51.38 
 
 
835 aa  700    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  52.46 
 
 
800 aa  684    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3348  cation-transporting ATPase transmembrane protein  48.79 
 
 
748 aa  629  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  48 
 
 
724 aa  622  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1916  copper-translocating P-type ATPase  48.79 
 
 
791 aa  610  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1058  heavy metal translocating P-type ATPase  47.99 
 
 
754 aa  611  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  47.4 
 
 
789 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2466  heavy metal translocating P-type ATPase  47.28 
 
 
745 aa  575  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392778  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  48.4 
 
 
823 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  44.55 
 
 
743 aa  569  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  43.32 
 
 
799 aa  566  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  43.52 
 
 
815 aa  561  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  43.26 
 
 
794 aa  556  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  43.77 
 
 
803 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  43.24 
 
 
802 aa  554  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1894  heavy metal translocating P-type ATPase  44.26 
 
 
754 aa  555  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  43.24 
 
 
802 aa  554  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  42.65 
 
 
797 aa  547  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  41.36 
 
 
797 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  40.88 
 
 
805 aa  538  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  41.72 
 
 
817 aa  535  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  41.21 
 
 
798 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1340  copper-translocating P-type ATPase  44.23 
 
 
796 aa  535  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  41.81 
 
 
821 aa  525  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  42.44 
 
 
806 aa  524  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  42.13 
 
 
805 aa  519  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  42.06 
 
 
794 aa  520  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1051  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  44.7 
 
 
735 aa  521  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  39.66 
 
 
796 aa  522  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  41.04 
 
 
805 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  42.08 
 
 
806 aa  521  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  40.78 
 
 
805 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  40.91 
 
 
805 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  41.04 
 
 
805 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  42.33 
 
 
806 aa  519  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  40.78 
 
 
805 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  40.9 
 
 
798 aa  513  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  42.23 
 
 
826 aa  513  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  40.9 
 
 
798 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  40.92 
 
 
827 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  41.56 
 
 
840 aa  508  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  39.95 
 
 
868 aa  505  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  41.88 
 
 
837 aa  504  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  41.63 
 
 
837 aa  505  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  39.23 
 
 
841 aa  501  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  39.64 
 
 
833 aa  499  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  40.44 
 
 
827 aa  499  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  39.39 
 
 
885 aa  501  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  39.14 
 
 
758 aa  501  1e-140  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  40.75 
 
 
841 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  40.69 
 
 
836 aa  500  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  40.16 
 
 
841 aa  501  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
818 aa  498  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  44.06 
 
 
801 aa  498  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  41.04 
 
 
855 aa  498  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  42.28 
 
 
793 aa  498  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>