More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1689 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  46.12 
 
 
828 aa  728    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2452  copper-translocating P-type ATPase  44.91 
 
 
797 aa  648    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.7313  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  47.37 
 
 
849 aa  714    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
835 aa  637    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  59.5 
 
 
794 aa  966    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  46.56 
 
 
840 aa  682    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  61.17 
 
 
805 aa  974    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  60.79 
 
 
805 aa  996    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  45.3 
 
 
836 aa  685    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  46.73 
 
 
744 aa  662    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  45.11 
 
 
835 aa  647    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  45.85 
 
 
820 aa  665    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  81.83 
 
 
798 aa  1310    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  61.04 
 
 
805 aa  974    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  61.17 
 
 
805 aa  974    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  61.17 
 
 
805 aa  976    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  45.3 
 
 
836 aa  685    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  45.86 
 
 
817 aa  667    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  47.27 
 
 
885 aa  759    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  49.08 
 
 
836 aa  765    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  47.32 
 
 
836 aa  707    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  61.04 
 
 
806 aa  974    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  44.66 
 
 
826 aa  645    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  43.21 
 
 
811 aa  640    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  47.46 
 
 
954 aa  718    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  46.8 
 
 
790 aa  669    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  50.13 
 
 
753 aa  734    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  43.79 
 
 
792 aa  648    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  44.27 
 
 
823 aa  639    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0657  copper-translocating P-type ATPase  49.05 
 
 
724 aa  659    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.737443  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  45.02 
 
 
797 aa  658    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  46.57 
 
 
760 aa  648    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  44.05 
 
 
834 aa  644    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  59.32 
 
 
802 aa  972    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  81.83 
 
 
798 aa  1310    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  49.54 
 
 
752 aa  719    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  73.25 
 
 
796 aa  1190    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2772  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  45.39 
 
 
798 aa  643    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  45.67 
 
 
868 aa  665    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  45.19 
 
 
813 aa  678    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  61.04 
 
 
805 aa  974    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  45.04 
 
 
839 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  48.92 
 
 
747 aa  675    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  45.61 
 
 
841 aa  668    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  50.31 
 
 
801 aa  679    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  45.4 
 
 
833 aa  662    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  45.79 
 
 
857 aa  715    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  47.4 
 
 
821 aa  688    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  58.26 
 
 
815 aa  910    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  43.91 
 
 
861 aa  654    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  44.35 
 
 
799 aa  638    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  49.88 
 
 
837 aa  756    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  44.69 
 
 
827 aa  676    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  45.82 
 
 
831 aa  650    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  46.79 
 
 
759 aa  661    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  44.82 
 
 
827 aa  652    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  45.19 
 
 
838 aa  640    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  50.36 
 
 
942 aa  757    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  44.46 
 
 
841 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  46.83 
 
 
804 aa  701    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  45.51 
 
 
828 aa  717    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  44.98 
 
 
852 aa  654    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  51.27 
 
 
817 aa  639    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  57.64 
 
 
821 aa  870    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  48.71 
 
 
838 aa  743    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  48.9 
 
 
836 aa  751    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  47.13 
 
 
833 aa  712    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  43.37 
 
 
814 aa  655    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  43.62 
 
 
800 aa  635    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  61.04 
 
 
806 aa  972    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  60.67 
 
 
806 aa  966    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  45.23 
 
 
797 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  49.56 
 
 
976 aa  704    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  61.17 
 
 
805 aa  977    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  50.46 
 
 
751 aa  674    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  43.21 
 
 
811 aa  640    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  54.2 
 
 
803 aa  829    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  45.52 
 
 
855 aa  666    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  45.4 
 
 
866 aa  711    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  49.88 
 
 
889 aa  779    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  50.12 
 
 
889 aa  777    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  48.56 
 
 
758 aa  684    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  43.52 
 
 
821 aa  637    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  58.74 
 
 
743 aa  833    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  44.39 
 
 
841 aa  644    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  52.43 
 
 
799 aa  782    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  45.44 
 
 
827 aa  654    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  44.81 
 
 
782 aa  636    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  44.46 
 
 
792 aa  654    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  41.98 
 
 
844 aa  648    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  45.78 
 
 
742 aa  657    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  50.07 
 
 
759 aa  719    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  43.77 
 
 
802 aa  650    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  47.98 
 
 
814 aa  712    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  47.59 
 
 
750 aa  687    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  59.32 
 
 
802 aa  972    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  48.11 
 
 
786 aa  679    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  46.33 
 
 
826 aa  679    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  56.89 
 
 
797 aa  867    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  43.19 
 
 
866 aa  668    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>