More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1952 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  50.4 
 
 		 1063 aa  685    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  50.55 
 
 		 799 aa  653    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  50.69 
 
 		 799 aa  653    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  50.28 
 
 		 800 aa  651    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3348  cation-transporting ATPase transmembrane protein  50.56 
 
 		 748 aa  677    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1916  copper-translocating P-type ATPase  48.75 
 
 		 791 aa  638    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  52.95 
 
 		 817 aa  716    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 		 732 aa  660    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  50.53 
 
 		 1061 aa  687    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  52.74 
 
 		 813 aa  717    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  50.96 
 
 		 732 aa  670    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  51.31 
 
 		 792 aa  665    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3376  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  51.65 
 
 		 819 aa  678    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  52.3 
 
 		 790 aa  704    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  50.46 
 
 		 1061 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  52.21 
 
 		 797 aa  682    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  50.4 
 
 		 1040 aa  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  50.68 
 
 		 835 aa  682    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  50.34 
 
 		 741 aa  694    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  51.07 
 
 		 971 aa  676    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  50.4 
 
 		 1061 aa  685    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  100 
 
 		 724 aa  1469    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0938  heavy metal translocating P-type ATPase  52.45 
 
 		 730 aa  699    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.485974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  52.45 
 
 		 730 aa  699    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  52.73 
 
 		 816 aa  692    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  49.41 
 
 		 795 aa  675    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  50.49 
 
 		 793 aa  692    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  49.41 
 
 		 872 aa  669    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  50.82 
 
 		 740 aa  701    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  53.59 
 
 		 804 aa  716    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3524  heavy metal translocating P-type ATPase  52.21 
 
 		 813 aa  665    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  50.75 
 
 		 1182 aa  671    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  50.67 
 
 		 1021 aa  676    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  50.55 
 
 		 739 aa  672    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  50.75 
 
 		 799 aa  654    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  49.93 
 
 		 1013 aa  664    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  50.87 
 
 		 946 aa  673    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  51.31 
 
 		 792 aa  664    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  50.67 
 
 		 1021 aa  676    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  50.4 
 
 		 1061 aa  685    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  50.33 
 
 		 937 aa  661    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  49.66 
 
 		 789 aa  670    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  50.4 
 
 		 1063 aa  685    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  52.22 
 
 		 790 aa  672    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1407  heavy metal translocating P-type ATPase  48 
 
 		 758 aa  622  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.688507  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0037  heavy metal translocating P-type ATPase  46.12 
 
 		 782 aa  617  1e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374671  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0019  heavy metal translocating P-type ATPase  45.99 
 
 		 782 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0024  heavy metal translocating P-type ATPase  47.66 
 
 		 757 aa  611  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  47.79 
 
 		 767 aa  609  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  44.35 
 
 		 743 aa  592  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  44.7 
 
 		 798 aa  592  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  44.92 
 
 		 797 aa  590  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  48.8 
 
 		 823 aa  588  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1894  heavy metal translocating P-type ATPase  46.24 
 
 		 754 aa  588  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  43.72 
 
 		 815 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  44.31 
 
 		 797 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0031  heavy metal translocating P-type ATPase  48.37 
 
 		 747 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  44.08 
 
 		 803 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  44.64 
 
 		 798 aa  571  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  44.64 
 
 		 798 aa  571  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  43.83 
 
 		 805 aa  566  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2466  heavy metal translocating P-type ATPase  47.05 
 
 		 745 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392778  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  41.71 
 
 		 802 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  41.71 
 
 		 802 aa  560  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  42.23 
 
 		 794 aa  556  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  44.77 
 
 		 799 aa  556  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  42.03 
 
 		 796 aa  554  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  42.26 
 
 		 760 aa  550  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  41.96 
 
 		 889 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  41.96 
 
 		 889 aa  549  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  43.69 
 
 		 805 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1058  heavy metal translocating P-type ATPase  45.72 
 
 		 754 aa  548  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  43.96 
 
 		 805 aa  548  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  44.14 
 
 		 976 aa  548  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  44.23 
 
 		 806 aa  548  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  43.96 
 
 		 806 aa  545  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  43.55 
 
 		 805 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  43.55 
 
 		 805 aa  542  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  43.69 
 
 		 805 aa  545  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  43.55 
 
 		 805 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  43.66 
 
 		 821 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 		 806 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  41.92 
 
 		 837 aa  537  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  46.09 
 
 		 801 aa  536  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  39.92 
 
 		 817 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  41.84 
 
 		 828 aa  535  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  41.63 
 
 		 744 aa  532  1e-150  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  41.13 
 
 		 758 aa  533  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1340  copper-translocating P-type ATPase  43.78 
 
 		 796 aa  535  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  42.3 
 
 		 894 aa  535  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  41.44 
 
 		 885 aa  535  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  42.44 
 
 		 818 aa  531  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  40.26 
 
 		 836 aa  530  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 794 aa  531  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  43.28 
 
 		 793 aa  528  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  41.58 
 
 		 750 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3058  copper-translocating P-type ATPase  41.63 
 
 		 740 aa  526  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  42.65 
 
 		 836 aa  528  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 752 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  40.27 
 
 		 828 aa  524  1e-147  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>