More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3877 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  45.17 
 
 
891 aa  649    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  46.91 
 
 
797 aa  665    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  45.7 
 
 
744 aa  640    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3170  heavy metal translocating P-type ATPase  44.81 
 
 
936 aa  642    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  45.94 
 
 
867 aa  674    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  49.27 
 
 
894 aa  731    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 
760 aa  1544    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  45.47 
 
 
868 aa  671    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  46.25 
 
 
839 aa  661    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  50.45 
 
 
758 aa  735    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  47.04 
 
 
837 aa  675    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  46.5 
 
 
798 aa  655    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1233  hypothetical protein  46.24 
 
 
810 aa  635    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  51.07 
 
 
889 aa  741    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  50.4 
 
 
889 aa  736    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  45.34 
 
 
925 aa  653    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  48.75 
 
 
742 aa  700    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  51.73 
 
 
818 aa  744    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  45.17 
 
 
786 aa  655    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  45.54 
 
 
831 aa  640    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01260  copper/silver-translocating P-type ATPase  47.69 
 
 
905 aa  681    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  47.14 
 
 
824 aa  687    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  45.32 
 
 
815 aa  638    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  44.61 
 
 
905 aa  669    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  43.7 
 
 
759 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  46.68 
 
 
798 aa  633  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  46.53 
 
 
743 aa  632  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  43.7 
 
 
759 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  46.68 
 
 
798 aa  633  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  45.22 
 
 
837 aa  633  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  43.87 
 
 
805 aa  630  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1553  heavy metal translocating P-type ATPase  44.86 
 
 
859 aa  627  1e-178  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.534956  normal  0.0124284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  43.66 
 
 
753 aa  624  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  43.52 
 
 
752 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  45.3 
 
 
796 aa  620  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  43.73 
 
 
802 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  43.68 
 
 
836 aa  620  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  43.73 
 
 
802 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  45.17 
 
 
789 aa  618  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  44.4 
 
 
806 aa  615  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  44.2 
 
 
805 aa  617  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  43.79 
 
 
837 aa  616  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  43.86 
 
 
750 aa  618  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  44.2 
 
 
805 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  44.96 
 
 
841 aa  617  1e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  44.55 
 
 
806 aa  616  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  43.93 
 
 
805 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  43.93 
 
 
805 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  44.2 
 
 
805 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  43.92 
 
 
833 aa  612  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  44.06 
 
 
805 aa  611  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  44.15 
 
 
806 aa  612  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  42.05 
 
 
836 aa  610  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  44.3 
 
 
855 aa  611  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  44.36 
 
 
835 aa  608  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  43.01 
 
 
794 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  43.44 
 
 
762 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  43.48 
 
 
833 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  44.26 
 
 
838 aa  608  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  43.06 
 
 
840 aa  602  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3058  copper-translocating P-type ATPase  43.44 
 
 
740 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  43.63 
 
 
836 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  43.44 
 
 
767 aa  605  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  43.44 
 
 
762 aa  605  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  43.63 
 
 
836 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2185  heavy metal translocating P-type ATPase  43.54 
 
 
754 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  43.67 
 
 
837 aa  602  1.0000000000000001e-171  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  43.44 
 
 
762 aa  605  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  45.3 
 
 
797 aa  601  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  43.31 
 
 
762 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  42.58 
 
 
827 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  44.24 
 
 
852 aa  600  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  43.1 
 
 
827 aa  599  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  42.71 
 
 
814 aa  600  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
826 aa  602  1e-170  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  41.76 
 
 
885 aa  599  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  42.97 
 
 
827 aa  601  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  45.01 
 
 
803 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  43.16 
 
 
839 aa  598  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  42.99 
 
 
819 aa  598  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3653  heavy metal translocating P-type ATPase  41.09 
 
 
805 aa  591  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  42.63 
 
 
826 aa  588  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  44.81 
 
 
821 aa  591  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  43.43 
 
 
954 aa  591  1e-167  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  44.09 
 
 
817 aa  591  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  42.71 
 
 
821 aa  590  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  43.11 
 
 
759 aa  585  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3584  copper-translocating P-type ATPase  41.56 
 
 
805 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  42.8 
 
 
747 aa  587  1e-166  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  43.32 
 
 
942 aa  588  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  43.44 
 
 
839 aa  585  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0657  copper-translocating P-type ATPase  44.95 
 
 
724 aa  587  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.737443  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  42.58 
 
 
841 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  42.39 
 
 
814 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  44.79 
 
 
751 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  44.27 
 
 
799 aa  585  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6890  copper-translocating P-type ATPase  41.45 
 
 
754 aa  582  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  43.14 
 
 
759 aa  582  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  43.65 
 
 
826 aa  580  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3496  copper-translocating P-type ATPase  41.01 
 
 
805 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>