More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3170 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  45.35 
 
 
758 aa  691    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  46.43 
 
 
839 aa  637    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  42.35 
 
 
797 aa  639    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  47.04 
 
 
753 aa  637    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  65.38 
 
 
868 aa  1066    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  44.58 
 
 
760 aa  657    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  44.95 
 
 
821 aa  664    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01260  copper/silver-translocating P-type ATPase  46.02 
 
 
905 aa  639    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  45.5 
 
 
836 aa  644    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  57.21 
 
 
824 aa  899    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  46.89 
 
 
925 aa  639    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  44.63 
 
 
838 aa  649    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  44.72 
 
 
836 aa  651    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3170  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
936 aa  1839    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  46.08 
 
 
826 aa  637    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  57.45 
 
 
837 aa  909    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  44.47 
 
 
889 aa  783    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  44.36 
 
 
889 aa  781    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  55.21 
 
 
789 aa  786    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  46.57 
 
 
742 aa  677    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
815 aa  639    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  45.84 
 
 
837 aa  645    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  45.18 
 
 
818 aa  754    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  45.13 
 
 
894 aa  757    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  68.3 
 
 
905 aa  1122    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  40.85 
 
 
797 aa  630  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  44.19 
 
 
841 aa  626  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  45.42 
 
 
833 aa  626  1e-178  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  42.6 
 
 
817 aa  627  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  44.97 
 
 
833 aa  624  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  44.28 
 
 
840 aa  625  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  46.07 
 
 
752 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  45.36 
 
 
855 aa  624  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  44.67 
 
 
814 aa  624  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  44.27 
 
 
852 aa  622  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  44.9 
 
 
833 aa  623  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  40.39 
 
 
794 aa  620  1e-176  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  42.74 
 
 
837 aa  620  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  45.34 
 
 
831 aa  621  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  45.42 
 
 
827 aa  620  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  42.89 
 
 
803 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  44.55 
 
 
835 aa  621  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  43.84 
 
 
826 aa  619  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  42.77 
 
 
744 aa  616  1e-175  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  39.95 
 
 
796 aa  617  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  42.09 
 
 
798 aa  618  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  43.26 
 
 
841 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  45.76 
 
 
837 aa  619  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  43.74 
 
 
836 aa  615  9.999999999999999e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  43.74 
 
 
836 aa  615  9.999999999999999e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  43.39 
 
 
743 aa  615  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  45.21 
 
 
786 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  42.52 
 
 
891 aa  611  1e-173  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  40.62 
 
 
805 aa  612  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  41.61 
 
 
827 aa  610  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  43.36 
 
 
827 aa  610  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  42.13 
 
 
799 aa  612  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  42.66 
 
 
826 aa  607  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1553  heavy metal translocating P-type ATPase  46.33 
 
 
859 aa  607  9.999999999999999e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.534956  normal  0.0124284 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  41.06 
 
 
798 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  41.06 
 
 
798 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  46.54 
 
 
747 aa  600  1e-170  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  39.1 
 
 
839 aa  601  1e-170  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  40.85 
 
 
806 aa  597  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  41.02 
 
 
857 aa  598  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  42.95 
 
 
782 aa  598  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1233  hypothetical protein  43.99 
 
 
810 aa  598  1e-169  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  40.74 
 
 
806 aa  598  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  43.84 
 
 
750 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  45.52 
 
 
838 aa  593  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  43.32 
 
 
867 aa  594  1e-168  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  42.51 
 
 
885 aa  593  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  40.67 
 
 
805 aa  595  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  43.59 
 
 
834 aa  594  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  40.67 
 
 
805 aa  595  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  45.65 
 
 
762 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  40.78 
 
 
805 aa  595  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  39.5 
 
 
802 aa  595  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  40.67 
 
 
805 aa  595  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  39.5 
 
 
802 aa  595  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  39.11 
 
 
844 aa  593  1e-168  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  45.48 
 
 
762 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  40.55 
 
 
805 aa  591  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  40.44 
 
 
805 aa  590  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  44.82 
 
 
829 aa  591  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  45.48 
 
 
762 aa  592  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  45.52 
 
 
767 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  42.27 
 
 
819 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  45.4 
 
 
762 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  43.35 
 
 
758 aa  592  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  41.47 
 
 
759 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  41.47 
 
 
759 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  40.51 
 
 
806 aa  588  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  44.6 
 
 
841 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  39.31 
 
 
828 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  49.57 
 
 
755 aa  579  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  45.35 
 
 
829 aa  580  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  49.86 
 
 
823 aa  580  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  43.71 
 
 
821 aa  579  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1661  heavy metal translocating P-type ATPase  45.88 
 
 
825 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119959  normal  0.896938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>