More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0392 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  47.28 
 
 		 752 aa  677    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  65.26 
 
 		 759 aa  959    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1259  heavy metal translocating P-type ATPase  60.37 
 
 		 834 aa  840    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  62.2 
 
 		 819 aa  923    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  57.89 
 
 		 826 aa  835    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  99.61 
 
 		 767 aa  1518    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  47.25 
 
 		 805 aa  656    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0270  copper-translocating P-type ATPase  48.92 
 
 		 748 aa  672    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  65.36 
 
 		 826 aa  967    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  74.83 
 
 		 852 aa  1124    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  83.75 
 
 		 841 aa  1267    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  47.25 
 
 		 805 aa  641    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  47.38 
 
 		 805 aa  640    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  47.25 
 
 		 805 aa  640    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  47.38 
 
 		 805 aa  639    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  46.07 
 
 		 759 aa  668    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  66.54 
 
 		 841 aa  965    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  47.3 
 
 		 815 aa  666    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  66.53 
 
 		 827 aa  971    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  70.08 
 
 		 839 aa  1035    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  69.51 
 
 		 840 aa  1030    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  47.14 
 
 		 753 aa  674    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2890  copper-translocating P-type ATPase  57.16 
 
 		 813 aa  744    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  61.31 
 
 		 834 aa  917    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  50.8 
 
 		 811 aa  692    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  47.38 
 
 		 805 aa  642    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  62.83 
 
 		 836 aa  905    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  47.25 
 
 		 805 aa  641    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  64.44 
 
 		 826 aa  957    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  48.47 
 
 		 747 aa  660    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  99.34 
 
 		 762 aa  1511    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  47.7 
 
 		 835 aa  659    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  47.73 
 
 		 797 aa  658    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00395  Cation transport ATPase  47.71 
 
 		 747 aa  672    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  62.62 
 
 		 829 aa  882    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  60.27 
 
 		 838 aa  845    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2086  heavy metal translocating P-type ATPase  59.97 
 
 		 744 aa  822    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  99.74 
 
 		 762 aa  1513    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  46.07 
 
 		 759 aa  668    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  57.76 
 
 		 856 aa  770    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  75.77 
 
 		 835 aa  1134    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  58.5 
 
 		 837 aa  837    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2185  heavy metal translocating P-type ATPase  49.8 
 
 		 754 aa  676    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  65.64 
 
 		 827 aa  973    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  46.44 
 
 		 750 aa  658    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  62.83 
 
 		 836 aa  905    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  66.14 
 
 		 841 aa  976    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  48.61 
 
 		 831 aa  664    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  58.82 
 
 		 824 aa  775    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2813  heavy metal translocating P-type ATPase  58.89 
 
 		 830 aa  783    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  46.87 
 
 		 740 aa  667    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  48.28 
 
 		 818 aa  683    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  47.25 
 
 		 747 aa  652    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  47.63 
 
 		 806 aa  642    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  61.16 
 
 		 838 aa  882    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  61.26 
 
 		 836 aa  905    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  60.08 
 
 		 833 aa  840    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  60.51 
 
 		 814 aa  857    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  44.72 
 
 		 758 aa  639    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2679  heavy metal translocating P-type ATPase  54.06 
 
 		 857 aa  779    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 		 762 aa  1521    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  52.23 
 
 		 751 aa  667    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  45.96 
 
 		 750 aa  664    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  74.19 
 
 		 855 aa  1113    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  46 
 
 		 758 aa  652    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  47.38 
 
 		 806 aa  640    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  58.89 
 
 		 832 aa  760    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  50.4 
 
 		 821 aa  710    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  46.66 
 
 		 743 aa  640    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0212  copper-translocating P-type ATPase  48.52 
 
 		 746 aa  650    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  62.2 
 
 		 827 aa  900    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  58.75 
 
 		 832 aa  775    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  47.86 
 
 		 778 aa  690    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1661  heavy metal translocating P-type ATPase  58.08 
 
 		 825 aa  790    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119959  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  46.87 
 
 		 839 aa  637    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  48.48 
 
 		 786 aa  664    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1536  heavy metal translocating P-type ATPase  56.95 
 
 		 813 aa  750    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.627747 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  54.26 
 
 		 807 aa  732    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  69.88 
 
 		 829 aa  1010    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  48.12 
 
 		 782 aa  691    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  45.55 
 
 		 844 aa  649    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  50.8 
 
 		 811 aa  692    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  46.85 
 
 		 742 aa  669    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  47.98 
 
 		 860 aa  655    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  99.74 
 
 		 762 aa  1517    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  48.07 
 
 		 797 aa  642    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  50.73 
 
 		 836 aa  684    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1129  heavy metal translocating P-type ATPase  55.57 
 
 		 840 aa  757    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.979362 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  50.52 
 
 		 795 aa  635    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  83.2 
 
 		 833 aa  1263    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  47.38 
 
 		 806 aa  644    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  81.34 
 
 		 833 aa  1220    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  48.41 
 
 		 837 aa  665    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  47.06 
 
 		 885 aa  634  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  46.9 
 
 		 798 aa  631  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  49.25 
 
 		 846 aa  630  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  43.62 
 
 		 889 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  43.35 
 
 		 889 aa  629  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  47.63 
 
 		 814 aa  629  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  50.6 
 
 		 724 aa  628  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>