More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2091 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00435  copper transporter  51.42 
 
 		 834 aa  717    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  51.42 
 
 		 834 aa  717    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  45.83 
 
 		 767 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  45.96 
 
 		 762 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01268  cation transport ATPase  46.43 
 
 		 898 aa  687    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2072  copper-translocating P-type ATPase  52.95 
 
 		 725 aa  723    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  47.73 
 
 		 835 aa  670    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  50.75 
 
 		 832 aa  727    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1689  cation transporter E1-E2 family ATPase  51.21 
 
 		 753 aa  754    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  45.99 
 
 		 827 aa  648    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  46.06 
 
 		 819 aa  659    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  43.79 
 
 		 833 aa  643    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  49.66 
 
 		 939 aa  717    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  45.96 
 
 		 762 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  46.21 
 
 		 840 aa  642    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  46.09 
 
 		 839 aa  652    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  44.13 
 
 		 836 aa  644    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  46.39 
 
 		 753 aa  644    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  66.76 
 
 		 747 aa  997    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  46.24 
 
 		 834 aa  637    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  51.56 
 
 		 834 aa  722    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  46.57 
 
 		 752 aa  651    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0552  copper exporting ATPase  51.15 
 
 		 833 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  45.71 
 
 		 747 aa  637    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  51.6 
 
 		 742 aa  782    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0562  copper exporting ATPase  51.01 
 
 		 833 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.304776  normal  0.828863 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1499  copper-translocating P-type ATPase  51.63 
 
 		 744 aa  731    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  47.04 
 
 		 837 aa  657    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  51.42 
 
 		 834 aa  716    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  46.58 
 
 		 827 aa  647    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  68.57 
 
 		 782 aa  1057    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  51.46 
 
 		 740 aa  781    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  51.42 
 
 		 834 aa  716    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3191  copper-translocating P-type ATPase  49.13 
 
 		 760 aa  733    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.427707  normal  0.767066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  51.15 
 
 		 834 aa  716    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  47.05 
 
 		 852 aa  669    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00395  Cation transport ATPase  65.18 
 
 		 747 aa  985    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  46.74 
 
 		 759 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  45.03 
 
 		 827 aa  644    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  52.65 
 
 		 850 aa  771    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0606  copper exporting ATPase  51.15 
 
 		 833 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  46.32 
 
 		 831 aa  650    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2255  copper-translocating P-type ATPase  52.02 
 
 		 869 aa  753    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2846  copper-translocating P-type ATPase  51.63 
 
 		 744 aa  731    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.515584  hitchhiker  0.000113532 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  45.43 
 
 		 836 aa  651    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  51.56 
 
 		 834 aa  721    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  46.09 
 
 		 826 aa  647    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  49.18 
 
 		 797 aa  646    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  51.56 
 
 		 834 aa  720    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  45.96 
 
 		 762 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 		 750 aa  1531    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  46.74 
 
 		 759 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  46.26 
 
 		 855 aa  647    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  45.58 
 
 		 826 aa  642    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004188  copper-translocating P-type ATPase  46.35 
 
 		 909 aa  685    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  51.09 
 
 		 907 aa  743    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2587  copper-translocating P-type ATPase  51.4 
 
 		 758 aa  757    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901243 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2654  copper-translocating P-type ATPase  51.53 
 
 		 758 aa  759    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0545  copper exporting ATPase  51.01 
 
 		 833 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0212  copper-translocating P-type ATPase  66.03 
 
 		 746 aa  975    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0270  copper-translocating P-type ATPase  65.55 
 
 		 748 aa  992    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1807  cation transporter E1-E2 family ATPase  46.59 
 
 		 915 aa  691    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  45.96 
 
 		 762 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  65.81 
 
 		 778 aa  1019    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0802  copper-transporting P-type ATPase  49 
 
 		 902 aa  727    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2761  copper-translocating P-type ATPase  51.88 
 
 		 753 aa  759    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  46.44 
 
 		 786 aa  666    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1408  copper-translocating P-type ATPase  51.49 
 
 		 744 aa  734    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.659936  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1505  copper-translocating P-type ATPase  51.56 
 
 		 744 aa  730    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  49.26 
 
 		 955 aa  714    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  51.15 
 
 		 833 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  64.69 
 
 		 844 aa  1010    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1535  copper-translocating P-type ATPase  50.95 
 
 		 744 aa  721    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.639562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  56.5 
 
 		 860 aa  843    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  48.72 
 
 		 913 aa  707    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  49.53 
 
 		 961 aa  718    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2772  copper-translocating P-type ATPase  51.32 
 
 		 757 aa  773    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  46.44 
 
 		 833 aa  659    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  46.78 
 
 		 841 aa  667    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  50.81 
 
 		 907 aa  733    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  49.59 
 
 		 955 aa  715    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1485  copper-translocating P-type ATPase  49.39 
 
 		 752 aa  699    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  46.04 
 
 		 837 aa  655    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  51.42 
 
 		 834 aa  717    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  46.33 
 
 		 750 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  45.52 
 
 		 826 aa  632  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  49.03 
 
 		 735 aa  633  1e-180  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  45.58 
 
 		 838 aa  634  1e-180  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  46.22 
 
 		 836 aa  635  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  46.22 
 
 		 836 aa  635  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  45.01 
 
 		 759 aa  630  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  48.13 
 
 		 735 aa  625  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  45.76 
 
 		 737 aa  628  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  45.78 
 
 		 841 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  45.29 
 
 		 818 aa  627  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1223  heavy metal translocating P-type ATPase  45.55 
 
 		 721 aa  621  1e-176  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  44.8 
 
 		 829 aa  620  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2679  heavy metal translocating P-type ATPase  45.92 
 
 		 857 aa  616  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  46.18 
 
 		 838 aa  617  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  44.86 
 
 		 833 aa  615  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>