More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2072 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00435  copper transporter  50.69 
 
 		 834 aa  667    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  50.69 
 
 		 834 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  49.04 
 
 		 907 aa  678    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0270  copper-translocating P-type ATPase  53.86 
 
 		 748 aa  758    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  50.14 
 
 		 833 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004188  copper-translocating P-type ATPase  46.98 
 
 		 909 aa  659    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2072  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 		 725 aa  1446    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  53.47 
 
 		 742 aa  796    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0552  copper exporting ATPase  50.14 
 
 		 833 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0606  copper exporting ATPase  50.14 
 
 		 833 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  47.83 
 
 		 819 aa  643    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00395  Cation transport ATPase  53.99 
 
 		 747 aa  763    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  50.55 
 
 		 834 aa  665    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2772  copper-translocating P-type ATPase  47.26 
 
 		 757 aa  653    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  48.16 
 
 		 827 aa  636    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  50.07 
 
 		 961 aa  687    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  50.69 
 
 		 834 aa  667    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  50.83 
 
 		 834 aa  674    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  49.93 
 
 		 955 aa  686    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  54.53 
 
 		 747 aa  766    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01268  cation transport ATPase  46.84 
 
 		 898 aa  658    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  49.04 
 
 		 832 aa  674    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  53.73 
 
 		 782 aa  779    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  49.47 
 
 		 831 aa  654    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  49.18 
 
 		 907 aa  677    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  49.54 
 
 		 837 aa  650    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  51.37 
 
 		 850 aa  677    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  47.53 
 
 		 913 aa  645    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0545  copper exporting ATPase  50.14 
 
 		 833 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  50.69 
 
 		 834 aa  667    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  50.69 
 
 		 834 aa  667    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  53.19 
 
 		 740 aa  794    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  52.95 
 
 		 750 aa  763    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  49.93 
 
 		 939 aa  670    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2587  copper-translocating P-type ATPase  46.32 
 
 		 758 aa  643    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901243 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2654  copper-translocating P-type ATPase  46.05 
 
 		 758 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0802  copper-transporting P-type ATPase  45.67 
 
 		 902 aa  649    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0212  copper-translocating P-type ATPase  53.09 
 
 		 746 aa  732    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  50.83 
 
 		 834 aa  673    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0562  copper exporting ATPase  50 
 
 		 833 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.304776  normal  0.828863 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  53.58 
 
 		 778 aa  763    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  47.39 
 
 		 797 aa  642    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2761  copper-translocating P-type ATPase  46.5 
 
 		 753 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  50.07 
 
 		 955 aa  694    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  52.47 
 
 		 844 aa  761    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  54.42 
 
 		 860 aa  744    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1807  cation transporter E1-E2 family ATPase  47.87 
 
 		 915 aa  656    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  50.83 
 
 		 834 aa  667    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2255  copper-translocating P-type ATPase  48.44 
 
 		 869 aa  665    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  46.84 
 
 		 753 aa  633  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  47.05 
 
 		 752 aa  635  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2846  copper-translocating P-type ATPase  46.65 
 
 		 744 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.515584  hitchhiker  0.000113532 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3191  copper-translocating P-type ATPase  46.1 
 
 		 760 aa  634  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.427707  normal  0.767066 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1499  copper-translocating P-type ATPase  46.65 
 
 		 744 aa  635  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1505  copper-translocating P-type ATPase  46.51 
 
 		 744 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1689  cation transporter E1-E2 family ATPase  45.33 
 
 		 753 aa  631  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6890  copper-translocating P-type ATPase  46.31 
 
 		 754 aa  630  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1535  copper-translocating P-type ATPase  46.37 
 
 		 744 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.639562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  47.68 
 
 		 762 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  47.55 
 
 		 767 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  47.63 
 
 		 836 aa  631  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  47.55 
 
 		 762 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  47.41 
 
 		 762 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  47.61 
 
 		 841 aa  628  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  46.58 
 
 		 818 aa  627  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  47.55 
 
 		 762 aa  628  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  46.7 
 
 		 836 aa  625  1e-178  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  47.98 
 
 		 826 aa  626  1e-178  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  47.35 
 
 		 835 aa  624  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  47.9 
 
 		 747 aa  624  1e-177  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  48.94 
 
 		 841 aa  624  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  47.89 
 
 		 852 aa  622  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  47.43 
 
 		 840 aa  622  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  47.61 
 
 		 833 aa  624  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  45.72 
 
 		 759 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  45.72 
 
 		 759 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1408  copper-translocating P-type ATPase  46.1 
 
 		 744 aa  620  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.659936  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  46.93 
 
 		 826 aa  619  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  47.48 
 
 		 833 aa  617  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  46.11 
 
 		 750 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  47.35 
 
 		 855 aa  615  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  48.03 
 
 		 827 aa  617  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  46.9 
 
 		 786 aa  615  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  47.04 
 
 		 837 aa  614  9.999999999999999e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1485  copper-translocating P-type ATPase  46.61 
 
 		 752 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  44.87 
 
 		 797 aa  608  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  44.71 
 
 		 758 aa  608  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  46.66 
 
 		 826 aa  608  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  46.96 
 
 		 838 aa  607  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6644  copper-translocating P-type ATPase  46.11 
 
 		 753 aa  605  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.935468  normal  0.257295 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  46.79 
 
 		 759 aa  606  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  45.84 
 
 		 814 aa  604  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  44.61 
 
 		 805 aa  601  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  45.42 
 
 		 839 aa  601  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  50.56 
 
 		 724 aa  600  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  45.66 
 
 		 759 aa  601  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  43.05 
 
 		 889 aa  598  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  43.09 
 
 		 889 aa  601  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  48.03 
 
 		 838 aa  601  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  45.59 
 
 		 827 aa  600  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>